目的:动物DNA条形码技术以线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因序列作为标记，可以实现动物药材的快速鉴定，解决动物药材鉴定难以标准化的问题，并且提高动物药材鉴定的准确性和便捷性。本文通过DNA条形码技术，利用COⅠ基因，对蜥蜴亚目部分药用动物进行分类鉴别，从而有效鉴定蜥蜴亚目部分药用动物，为制定动物药材的质量标准、建立动物药质量平台奠定基础。　　 方法:选取蜥蜴亚目部分药用动物为研究对象，应用DNA条形码技术，使用筛选出的DNA条形码引物进行测序扩增，并与GenBank收录的共3科7属12种样本的同源序列比对分析，计算碱基含量和种内、种间的遗传距离，构建系统发育树，再辅以动物原形态树进行对比校正，分析系统发育树，从而对所研究的59个蜥蜴亚目个体进行鉴定分类研究。　　 结果:所研究动物个体基因片段的G+C平均含量为46.5％，低于A+T平均含量(53.5％)，符合脊柱动物基因序列特点，所获得序列正确无误。所研究个体的种内遗传距离平均值为1.7％，种间遗传距离平均值为35.5％，是种内的21倍，系统发育树能够将所研究动物精确划分，与形态学分类基本相符。　　 结论:基于COⅠ基因片段序列构建的系统发育树表明，DNA条形码在所选动物科、属和种水平的分类鉴定与传统方法所得结果一致。此技术用于蜥蜴亚目药用动物物种间的鉴定是可行的，特别是对于非专业人员鉴定相关类群动物药材真伪具有较好的应用价值。