蓝细菌相关异养细菌的群落结构及溶原性分析

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ydfang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蓝细菌是水生生态系统中重要的初级生产者之一,对环境中与之共存的细菌群落有着重要的影响。病毒对于蓝细菌的侵染裂解活动,在改变蓝细菌宿主的丰度和群落结构的同时,也对与之共存的异养细菌群落产生影响。溶原性细菌是细菌群落的重要组成部分,在海洋生态系统中广泛存在,前噬菌体的存在及其诱导也影响着海洋中的细菌群落及生态过程。本论文通过对河口富含藻蓝蛋白(phycocyanin-rich,PC-rich)和富含藻红蛋白(phycoerythrin-rich,PE-rich)蓝细菌培养体系中异养细菌群落的对比分析,及病毒侵染裂解蓝细菌培养体系中的异养细菌群落结构的分析,探究蓝细菌及其病毒对相关异养细菌群落的影响。同时分析了蓝细菌相关异养细菌(cyanobacteria associated heterotrophic bacteria,CAHB)的溶原性发生率,及诱导出前噬菌体的基因组学和进化特征,以及病毒在溶源性侵染层面对细菌群落的影响。本论文主要研究结果有:1.河口聚球藻PC-rich藻株CBW1101和PE-rich藻株CBW1107相关异养细菌均以α-变形菌纲、拟杆菌纲、浮霉菌纲、γ-变形菌纲为主要类群,但二者细菌类群相对丰度及多样性之间存在差异。2.病毒对蓝细菌的侵染裂解作用在一定程度上增加了与之相关的细菌群落的多样性。蓝细菌裂解产物所支撑的细菌群落与蓝细菌分泌物基本相同。细菌群落最高的多样性发生在裂解中期,而非后期。这表明病毒侵染蓝细菌的过程中对蓝细菌代谢的调节作用极大的改变了其释放的DOM组成,并对同一环境中细菌群落结构的改变具有十分重要的影响。3.从蓝细菌培养液中分离得到的27株蓝细菌相关异养细菌分离株主要为γ-变形菌纲,α-变形菌纲,放线菌纲和黄杆菌纲的细菌类群。分离株溶原菌占比为21%,与海洋细菌分离株中溶原菌相比比例偏低。4.三株前噬菌体的基因组中超过半数的ORF没有明确的蛋白功能。基于末端酶terL氨基酸序列的系统发育分析显示,Prop1,Prop2和Prop3分别代表了不同类型的未知病毒类群。三株前噬菌体具有相同的整合机制,都缺少常见的DNA复制代谢相关的基因,基因组中均存在多样的转录调控因子基因。转录调控因子对宿主代谢潜在的调节作用暗示了病毒在溶原水平上对宿主群落多样性的影响作用。5.前噬菌体Prop1和Prop2基因组中的RcGTA-like structure相关蛋白基因的排布与RcGTA高度相似,且其中分别有2和1个基因与RcGTA同源。前噬菌体Prop1和Prop2 RcGTA-like structures中多个基因与GTA序列具有较远的进化关系,这为“RcGTA是由前噬菌体祖先进化而来”这一假说提供了进一步的依据。
其他文献
<正>外语教育是建立在心理学、语言学和人类文化学基础之上,澄清现代语言学的研究结论,揭示语言的本质和作用,对外语教育有着特别重要的意义。本文对比研究了现代几种主要的
作者以兽用B超为基础,针对实际生产中肉牛皮厚、脂肪厚、腰肌厚、腰肌面积及肌间脂肪等指标的检测要求,综述了兽用B超在肉牛活体检测中的应用。
目的:结直肠癌是一种常见的消化道恶性肿瘤,既往有研究发现蛋白激酶相关激酶5(ARK5)可促进多种癌症的转移,并能增强癌症的侵袭性。而最近的证据支持上皮-间质转化(EMT)是肿瘤细胞转移的必经之路。在此次研究中,我们将进行探讨ARK5是否通过调节EMT途径来影响结直肠癌的转移和侵袭。方法:1.临床随机选取134名只接受根治性手术治疗未接受术前放化疗的结直肠癌患者(2013年1月至2014年1月),获
记者近日从江苏省南通市台办获悉,台湾欣兴电子股份有限公司将在南通经济技术开发区设立新的生产基地,总投资不少于4亿美元。按计划,欣兴电子新的生产基地主要生产印刷电路板
本论文是在中国气象局重大自然灾害预警与防范专项(项目编号:2017YFC1502000)的资助下完成的。本论文通过对ECMWF集合预报与ECMWF高分辨率数值预报对我国中部地区降水预报能力在确定性及概率性方面的预报能力进行了检验评估,得到了不同模式的各自优势并对不同模式的误差特征及产生原因进行了详细统计分析。在此基础上利用机器学习中的K-means聚类算法将我国中部地区根据预报特征的不同分为了8个
随着城市的规划发展,燃气调压站的数量每年成倍增长,为便于调压站的运行管理,需建立电子信息平台,以数据库为基础,囊括调压站所有信息。
状语是汉语中重要的句法成分之一,由于汉语状语本身的复杂性,状语成为了第二语言习得者习得汉语的重难点。本文以北京语言大学HSK动态作文语料库和笔者日常教学中收集的英语
心脏病是老年人常见的疾病,轻者影响老年人的健康,重者往往危及生命。因此掌握老年人心脏病的特点,早期诊断治疗,精心护理都有重要的临床意义。本文结合我院2006—2010年86例老年
作者对我科自2003年5月至12月进行阴道镜检查的1 610例宫颈病变患者进行了配合与细心护理,如:环境、患者及用物准备、活检时及阴道镜检查完毕的护理、交叉感染的预防、对填表