利用EST序列与cDNA芯片分析板栗疫病菌基因表达谱

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低毒病毒/板栗疫病菌系统,是一个研究病毒宿主相互作用的优良的实验系统。为了更好地了解这种相互作用的分子机制,我们构建了一个处于产生分生孢子时期的野生型无病毒与受病毒感染的板栗疫病菌的cDNA文库。经序列测定,获得2403个表达序列标签(Expressed Sequence Tags, ESTs),代表1402个假定独立基因(Tentative Unique Transcripts, TUTs)。用这些独立基因与此前从培养7天尚未产生分生孢子的混和cDNA文库获得的3806个独立基因的cDNA组成的基因库,制备了包含产孢期与未产孢期两个不同发育阶段的共含4845个基因的cDNA芯片,并用于研究感染低毒病毒CHV1-EP713后板栗疫病菌基因表达谱的变化。结果表明,感染低毒病毒CHV1-EP713后,共有1055个基因表达丰度发生改变,其中370个上调,685个下调。对随机选取的10个表达丰度发生变化的基因进行荧光定量PCR验证,其中8个的结果与芯片结果吻合。表达丰度发生改变的基因包括了胁迫回应,核酸代谢和蛋白质代澍等多个方面。本研究结果为今后深入研究低毒病毒与其宿主的相互作用提供了新的基础。
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