家牛分为普通牛(Bostaurus)和瘤牛(Bos indicus),二者除了在外形上存在差异外,对于环境适应、生活习性、抗病力等方面都存在明显的差异,己有研究证明瘤牛与普通牛相比,对泰勒虫病和蜱虫感染有更强的抵抗力,而对锥虫病的抵抗力方面则较低。而目前关于普通牛与瘤牛之间抗病力差异的遗传基础的相关研究很少。本文利用蛋白质组学方法来研究普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织的差异蛋白质表达情况,从蛋白质组学水平解析二者间在抗病力方面差异的遗传基础。对普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织进行了 iTRAQ质谱检测,分别获得了肝脏、脾脏的蛋白质差异表达谱,以普通牛为参照样本,肝脏显著差异蛋白总数为197个,其中上调蛋白127个,下调蛋白70个,脾脏显著差异蛋白总数142个,其中上调蛋白77个,下调蛋白65个。对显著差异表达的蛋白质进行生物信息学分析,发现肝脏中差异表达蛋白质主要富集的GO条目是羧酸分解过程、有机酸分解过程、小分子分解过程;脾脏是组蛋白H3-K27三甲基化、核小体选位、受伤反应,免疫有关涉及的GO富集条目是免疫响应、免疫球蛋白复合物、免疫球蛋白受体结合等。肝脏中主要富集的KEGG代谢通路全为代谢类通路,主要是色氨酸代谢通路、β-丙氨酸代谢通路、赖氨酸降解通路等。本研究认为代谢对于动物的抗病力有很大的影响作用;脾脏中主要富集在蛋白质消化吸收通路、细胞外基质受体作用、溶酶体通路等,两个组织中的差异蛋白均有涉及锥虫病和其它原虫疾病的代谢通路。通过GO和KEGG注释分析,从肝脏和脾脏中分别找到差异蛋白质E1BPE1、Q1JPJ8、Q08DQ4、Q08DZ5;P15497、P02453、F6QPE0、Q1RMT8 参与锥虫病及一些原虫病的抗性,这些蛋白质大多以酶的形式直接或间接的参与到免疫系统中,预测这些差异蛋白与两种类型牛间的抗病力差异相关,其中E1BPE1上调蛋白与Q1JPJ8、P15497、Q1RMT8下调蛋白,四个差异蛋白涉及锥虫病通路,预测四个蛋白的表达量高低与瘤牛对于锥虫病抗性弱相关。PRM(parallel reaction monitoring)验证了其中的12个差异蛋白,显示与iTRAQ结果一致,表明本研究中肝脏和脾脏组织表达的蛋白质具有较高的可信度。本研究可为之后筛选一些与动物疾病潜在的生物标志物蛋白提供一定的参考价值。