对不同的G四联体的可折叠原理的理论研究

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DNA的G四联体结构是一种核酸的非经典二级结构,它被发现与上世纪六十年代,但是有关G四联体的研究兴起于上世纪九十年代后。很多研究证明发现,G四联体存在于生物体内的DNA和RNA中,具有很大的重要生物学的意义。由于科学技术的不断提高,许多生物大分子模拟的方法被大量研发了出来,其中利用最为广泛的模拟方法是分子动力学模拟。但是在本文中为了计算的便捷,本文采用了全原子Go模型进行分子动力学的模拟实验。  DNA的G四联体折叠的研究在最近几年中有了很大的发展,研究折叠原理的主要问题是研究G四联体的折叠机制。文章介绍的全原子Go模型是一个先进的粒子模型研究体系,因为本文研究的是不同的DNA的G四联体的折叠,在人体的端粒序列中,通过鸟嘌呤堆积起来的G四联体是一个很有希望的抗癌的目标。在本文的研究中,使用的是以能量为背景的折叠原理来说明凝血酶适体和两种人工的DNA的G四联体的折叠过程的原理。本文通过三种DNA的折叠过程的图像研究,在恒定的温度状态下,通过不同时间段的折叠过程,在折叠态、变性态和过渡态产生不同的能量图像,然后进行分析研究。本文运用全原子Go模型对三种不同的G四联体进行理论分析计算,产生自由能图像后,对均方根偏差、径向分布函数、距离以及相对接触距离和两个G三联体自然接触函数图进行了分析与比较。得到的图像与实验的研究相差不是很大,比较符合实际。  虽然本文运用的全原子Go模型进行研究后得到的成果比较符合实际,但是通过和实验所产生的数据相比还是有一定的差距,全原子Go模型的运用和研究与其他的研究模型相比,它可以提高工作的效率,得到更加全面的数据。
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