拟南芥盐和干旱胁迫下调控网络分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cs19890126
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目前的研究发现,植物在胁迫条件下表达大量胁迫相关基因,部分转录因子参与了胁迫响应,进而调控胁迫响应基因的表达。本文利用拟南芥胁迫下的表达谱数据和相应的转录调控数据构建调控网络,发现了不同转录因子和代谢途径之间的相互作用关系,阐述了胁迫下的调控机制。我们还从代谢途径的显著性角度出发找到了显著相关的代谢途径。   在盐胁迫调控网络中,我们发现转录因子AT5G01380和AT4G31800有共同的下游基因。转录因子WRKY53通过调控转录因子ATWRKY18和GBF3来调控下游的代谢途径。转录因子ATWRKY18,GT-3b(AT5G01380)和GBF3的共同作用P450代谢途径响应胁迫。   在盐和干旱胁迫下的共调控网络中,转录因子AGL15和ARR10下调降解相关的代谢途径。转录因子AGP1和ATERF-2激活alpha亚麻酸和苯丙素代谢途径。
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