三种食源性致病菌的LAMP检测方法研究

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摘要:近年来,国内外报道的由食源性致病菌引起的食物中毒事件越来越多。阪崎肠杆菌、单增李斯特菌和志贺氏菌都属于食源性致病菌。误食之后引起人类各种疾病,危及生命。为了确保食品的安全性,需要大力加强食品的检验力度,建立快速、灵敏的检测手段。本论文以建立快速检测这三种致病菌的LAMP方法为主要研究目的,为食品安全的快速检测提供技术支持。本研究针对阪崎肠杆菌16S/23S rDNA IGS序列(NCBI登录号AY748354.1),单增李斯特菌iap基因(NCBI登录号NC003210.1),志贺氏菌ipaH基因(NCBI登录号HE616529.1)分别设计LAMP特异性引物,内引物FIP/BIP,外引物F3/B3。同样区域设计荧光定量PCR引物,构建标准质粒。对建立的LAMP反应体系进行条件优化,确定其反应体系为:10mmol/L内引物(FIP&BIP),10mmol/L外引物(F3&B3),10mmol/LdNTPs,5M Betaine,16mmol/L MgSO4,20mmol/LKCl,20mmol/L (NH42SO4,0.2%TritonX-100,8U Bst DNA Polymerase,1μL DNA模板,双蒸水补足25μL总体积。在67℃保温60min。实验结果可通过三种方式鉴定,直接肉眼观察是否有白色沉淀产生或浑浊度变化,添加荧光染料SYBR Green I1μL,在紫外透射仪下观察是否有绿色荧光反射,同样也可将反应产物凝胶电泳,是否有梯形条带产生。对设计的三个菌的LAMP引物做了特异性实验和灵敏度实验。实验结果显示,三组引物特异性良好,灵敏度试验中梯度稀释DNA模板,阪崎肠杆菌的检出限为91fg/uL,单增李斯特菌的检出限为9.6fg/uL,志贺氏菌的检出限为27.5fg/uL。在模拟食样实验中,分别单独用单增李斯特菌、阪崎肠杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌增菌液人工污染脱脂乳,用煮沸法粗提取基因组,用LAMP方法与荧光定量PCR方法做参照检测特异性,实验结果显示,能准确检测出引物所对应的菌种,且阪崎肠杆菌LAMP方法的检出限为101CFU/mL,荧光定量PCR的检出限为102CFU/mL;单增李斯特菌LAMP方法的检出限为3×100CFU/mL,荧光定量PCR的检出限为3×101CFU/mL;志贺氏菌LAMP方法的检出限为4×100CFU/mL,荧光定量PCR的检出限为4×101CFU/mL。LAMP检测方法不仅能达到荧光定量PCR方法的准确性,而且检测限更低,灵敏度更高。实际样品检测样中,分别与阪崎肠杆菌、单增李斯特菌、志贺氏菌行业标准检测法(sN/T1632.1-2005[v6])做比较,结果表明:76份奶粉中阪崎肠杆菌,LAMP方法的阳性检出率为3.95%,检出时间为l.5h。76份奶粉中志贺氏菌,LAMP方法的阳性检出率为3.95%,检出时间为l.5h。54件肉制品中,单增李斯特菌的LAMP方法的阳性检出率为13.0%,检出时间为2.0h。LAMP方法在对样品的检测更加灵敏,且更省时。本研究分别建立了阪崎肠杆菌、单增李斯特菌和志贺氏菌的LAMP快速检测方法,开发单增李斯特菌LAMP快速检测试剂盒,建立三种LAMP反应结果目测方法,基本实现了现场快速检测的目标。该方法特异性强,灵敏度高,检测时间短,为食品中致病菌的检测提供了一个新的检测平台,为检测机构推广此技术提供了技术支持。
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