国家重点实验室建设计划是我国20世纪80年代初在基础性研究领域所做出的一项具有前瞻性的重要战略决策，探索适合我国基础研究发展的新体制和新机制是实施国家重点实验室建设的重要目标之一。国家重点实验室大胆创新和实施的“共建－共管“模式为克服我国科研体制条块分割、资源分散和低水平重复的弊端做出了重要贡献，国家重点实验室建设20年成绩斐然。然而，这种模式在实际操作中还存在一些问题，国家重点实验室的作用没有充分发挥出来。为建立适合我国国情、符合科技发展规律、与国际通行模式接轨的国家重点实验室运行管理体系，必须改革和完善现有的“共建－共管”模式。本文突破传统上单纯从某一角度或从实验室本身出发展开研究、构建理论框架的局限，在充分了解国家重点实验室建设背景、目的、功能作用的基础上，力图站在时代、国家战略的高度，紧密结合政府职能，运用经济学、公共经济学、管理学、科技管理学等相关理论知识，按照理论到实践、抽象到具体、宏观到微观的逻辑框架，多角度、全方位对国家重点实验室的“共建－共管”模式的内涵、利弊进行了分析和研究，并针对这种模式存在的问题，借鉴发达国家实验室改革的成功经验，探讨了改革和完善这种模式的对策建议：合理定位国家重点实验室的功能；健全政府主导的多渠道经费筹集机制；建立结构合理、关系理顺的管理组织队伍；完善国家重点实验评估工作；实现“依托”和“相对独立”的良性互动；强化国家重点实验室的信息化、网络化建设等。