ITGAM基因多态性与汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究

来源 :蚌埠医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bbpooh123
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目的:研究整联蛋白αM(Integrin, Alpha M, ITGAM)基因多态性与汉族人系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus, SLE)易感性的关系。  方法:根据美国风湿病学会(ACR)1997年修订的SLE分类标准选取中国汉族 SLE患者330例,同时选择无亲缘关系的健康体检者330例。采用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)技术对 ITGAM基因的三个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)进行基因分型。对分型结果进行质量控制,对符合要求的SNP位点采用卡方检验比较各多态位点在SLE组与对照组间的基因型频率及等位基因频率差异,应用Haploview4.1软件进行连锁不平衡分析,PHASE2.1软件分析单倍型。  结果:1. SNP rs2359661位点的等位基因(T)频率在SLE组(22.8%)和正常对照组(27.7%)中差异存在统计学意义(χ2=3.97, P=0.046),携带T等位基因可能会降低SLE的发病风险(OR=0.77,95%CI=0.60-1.00)。rs2359661的三种基因型CC、CT、TT在SLE组中的分布频率为61.8%、30.9%、7.3%,在对照组中为50.7%、43.3%、6.0%,两组差异有统计学意义(χ2=10.42, P=0.005)。以C/C基因型为参照,C/T基因型携带者的SLE发病风险降低(OR=0.58,95%CI=0.42-0.82),对T等位基因进行显隐性效应检验,在显性效应检验中,差异具有统计学意义(χ2=7.85, P=0.005)。2. SNP rs8048583位点的等位基因(T)频率在SLE组(27.5%)和正常对照组(30.4%)中差异无统计学意义(χ2=0.26, P=0.263)。rs8048583的三种基因型CC、CT、TT在SLE组中的分布频率为53.3%、38.4%、8.3%,在对照组中为45.0%、49.2%、5.8%,两组差异有统计学意义(χ2=7.56, P=0.023)。以C/C基因型为参照, C/T基因型携带者的SLE发病风险降低(OR=0.66,95%CI=0.47-0.92),对T等位基因进行显隐性效应检验,在显性效应检验中,差异具有统计学意义(χ2=4.22, P=0.040)。3.SNP rs1143679位点的等位基因(A)频率在SLE组(1.5%)和正常对照组(1.8%)中差异无统计学意义(χ2=0.16,P=0.687), rs1143679的三种基因型AA、AG、GG在SLE组中的分布频率为0.9%、1.2%、97.9%,在对照组中为1.3%、1.0%、97.7%,两组差异亦无统计学意义(χ2=0.31, P=0.857)。4. rs1143679、rs2359661和rs8048583连锁不平衡分析表明:rs2359661和rs8048583之间D’=0.962,r2=0.911,这2个SNP之间高度连锁,其他SNPs之间连锁性较低。5.CTT和CGG这两种主要的单倍型在正常对照及SLE患者中分布均无显著差异(P>0.05)。  结论:1. ITGAM基因三个单核苷酸多态性(rs2359661、rs8048583和rs1143679)在中国内地汉族人群中均存在。2. ITGAM基因上rs2359661的多态性可能与SLE易感性相关,且等位基因T可能是一个保护性因素,具有显性效应,可能降低 SLE的易感性。3.ITGAM基因上rs1143679和rs8048583的多态性可能与SLE易感性无关。4.rs2359661和rs8048583之间高度连锁,但CTT和CGG这两种主要的单倍型与SLE的易感性无关。
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