小麦族基本染色体组特异分子标记的筛选

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小麦族(Triticeae)是禾本科(Poaceae)植物中非常重要的一个类群,包含23个基本的染色体组。由二倍体物种自然杂交形成多倍体种,二倍体属和一些多倍体属植物之间的基因组系统关系、物种起源、基因组供体来源等存在较大的分歧。寻找并克隆一些基因组特异的DNA片段,对于研究物种的起源、进化及远缘杂交育种中外源遗传物质导入后的检测是很有必要的。根据对RPB2基因和Acc1基因序列的研究,发现不同染色体组的RPB2基因和Acc1基因序列存在不同程度的变异。本研究利用RPB2和Acc1基因的序列,设计了28对基因组特异引物,利用这些特异引物对小麦族19个基本染色体组23份二倍体材料和2份四倍体材料进行PCR扩增,筛选染色体组特异的分子标记。主要结果如下:(1) Ee染色体组特异引物F18/R18在Ee和Eb染色体组间表现很强的特异性,利用该引物检测材料Lo. elongatum、Th. bessaracum、Et. caespitosa ssp. nodusa、Et. caespitosa在含有Ee染色体组的材料中都有扩出约105bp的条带,而Eb染色体组没有条带。(2) P、H染色体组特异引物P-F2/R2、H-F2/R2在19个基因组中都扩增出约600bp的目的条带,不同基因组之间无明显差异。(3) St、W、V、E染色体组特异引物St-F2/R2、W-F2/R2、V-F2/R2、E-F3/R3在部分基因组中有扩增,扩增出的条带差异不明显。(4) St、Ns染色体组特异引物St-F3/R3、Ns-F1/R1扩增出现了明显的非特异性条带。(5) Ee染色体特异引物F19/R19, F22/R22在不同基因组中都有扩增,扩增条带无差异。综上,由于小麦族不同基因组之间存在部分同源性关系,要区别和筛选染色体组特异的分子标记比较困难。本实验设计的28对基因组特异引物中,仅有1对引物(Ee染色体组)扩增出一条Ee染色体组特异的条带。Ee染色体组特异引物F18/R18为快速检测含有Ee染色体组的物种提供一个分子水平上的依据。
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