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产学研合作是指企业、科研院所和高等学校之间的合作，是科技经济一体化的必然结果。产学研合作其实质是促进技术创新所需各种生产要素的有效组合，是促进企业成为技术创新主体的重要途径。 当前，在国家实施中长期科技发展规划，推进自主创新战略，建设以企业为主体和产学研结合的技术创新体系以及区域创新体系的形势下，本文首先对产学研合作研究理论和本文涉及的相关理论进行了综述；分析了国内外产学研合作模式现状；并以合肥工业大学为例采用PSESTN法分析了产学研合作的外部环境，重点分析了合肥工业大学产学研合作的现状，得出合肥工业大学产学研合作中存在的问题；最后针对这些问题，以提升自主创新能力为目的，提出了建立公平的开放内部环境，由自组织的cell团队、整合全校研发资源的虚拟研究院为主体构成的基于自组织创新的研发体系和统一对外进行产学研合作的产学研促进中心的全新产学研整体解决方案。