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重复序列(SSR)标记的应用有助于区分水稻中的高度多态性,是用于估计近缘基因型间遗传多样性的主要手段。本研究中,共使用22个微卫星分子标记对21个水稻品种(3个来自中国的品种和18个携带非洲栽培稻基因的新渗入系)的特征和特异性进行分析.本研究旨在建立非洲栽培稻基因渗入系的DNA指纹图谱数据库,用于为非洲栽培稻基因渗入系提供遗传鉴定和亲缘关系分析。本研究中,利用改良CTAB法提取幼苗幼叶的基因组DNA,在2.0%琼脂糖凝胶上分离PCR产物,以溴化乙锭染色并在紫外光拍摄。PCR产物在6%变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳,利用硝酸银法对凝胶进行染色显影。以SSR方法,通过PCR技术筛选多态性,并已获得的多态性丰富的标记带型。每个位点的等位基因数变幅为2-6个,平均等位基因数为4.1。结果表明,不同基因型间的遗传差异可进一步用于材料鉴定。通过聚类分析将21个材料归为8组,与其系谱表现基本一致。其中ILA65和ILA78差异最小(相似系数0.98)。J23B与其他基因型间的差异表现最大,其相似系数在0.35左右。主成分分析表明,PCI贡献率最高,达65.1389%,其次是PC2为7.8560%,这2个因子的累积方差为72.9948%。这与通过加权配对组算术方法(UPGMA)获得的聚类分析结果相近。所有基因型之间的相似系数介于0.2308和0.9780之间,平均相似度0.6807。ILA65和ILA78之间相似度最高(0.9780),ILA19和J23B,ILA123和J23B之间的相似度最低(0.2308)。J23B与所有其它基因型的相似系数在0.2308至0.4396。在筛选获得的22对遗传多态性较好的引物中,RM297, RM208, RM337, RM336, RM213, RM26, RM342, RM186, RM202, RM310, RM80, RM274和RM121能稳定扩增,清晰易读。这对于材料鉴定和DNA指纹图谱数据库的构建具有一定意义。最后,我们为每个基因型创建了可用于鉴定的唯一编码。