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背景与目的：唇腭裂是最常见的颜面部畸形，也是世界范围内最常见的出生缺陷疾病之一。唇腭裂不仅造成患儿的容貌畸形，还影响患儿的吸吮、吞咽、语言及面部发育等功能及心理的发育，并发其他遗传性疾病的患者往往还伴发原发性智力低下和其他器官畸形。唇腭裂患者出生后往往需接受多次手术矫正治疗，产前诊断是有效避免出生缺陷唯一途径。 本研究从中、晚孕期胎儿水平深入研究唇腭裂的产前超声诊断及并采用新型全基因组诊断方法进行遗传病因学研究。包括以下三大部分：①在二维超声检查的基础上，应用三维超声成像方法，对比临床中相对较容易操作的三维唇腭裂成像模式“反转脸”、“弹脸法”和“V-型法”，探讨三维超声成像检查胎儿唇腭裂的方法技巧，寻求准确而有效的评估腭部的方法。②应用全基因组染色体微阵列技术检测先天性唇腭裂畸形病例，比较在单纯性唇裂、腭裂及唇腭裂的检出率差异，评价其在唇腭裂遗传病因诊断的价值。③应用全外显子高通量测序技术检测唇腭裂5个遗传家系，评价在实际临床检测中对遗传病因学诊断的有效性。 材料与方法：1.选择2012年1月至2014年1月在本院超声检查的60例唇腭裂病例，孕周为18-32周，依次采用二维超声、三维离线后容积图像分析胎儿颜面部，对正常胎儿唇腭部的显示率及成像特点进行对比分析，并对异常胎儿是否存在硬腭及软腭裂的诊断总结分析。 2.应用全基因组染色体微阵列技术对2012年1月至2015年1月在广州市妇女儿童医疗中心产前诊断中心及颌面外科就诊病例120例，其中因胎儿唇腭裂接受产前诊断病例60例（羊水22例，脐带血38例），颌面外科接受手术治疗的先天性唇腭裂患儿共计60例样本进行检测，采用美国Affymetrix公司的CytoScan750或HD芯片平台实验操作。芯片数据分析采用DGV、DECIPHER、CAGdb、ISCA、UCSC Genome Browser、OMIM及PUBMED等实验室的内部数据库对分析结果。 3.应用全外显子高通量测序技术对5个唇腭裂遗传家系，先证者家系成员共计15个样本进行检测，采用美国Illumina公司Hiseq2500高通量平台进行实验操作，测序数据进行相应流程处理后，家系分析及致病基因筛选，测序数据分析采用Exac、ClinVar、HGMD、Mutation Taster和SIFT、PloyPhen等数据库分析。 结果：1.三维成像诊断：60例二维超声诊断的唇裂病例中，12例（20%，12/60）为单纯性的唇裂，48例（80%，48/60）为唇裂合并腭裂，其中4例(4/48)为双侧唇裂合并双侧腭裂，44例（44/48）为单侧。三种不同三维成像分析方法，胎儿唇裂和牙槽突裂均可以被准确诊断，“反转脸”分析法可以诊断79.2%(38/48)的胎儿硬腭裂，“弹脸法”三维成像方法可疑诊断为87.5%（42/48），“V-型法”诊断准确率为87.5%（42/48）。对于软腭裂的诊断率分别是“反转脸”分析方法为0，“弹脸法”为20.8%（10/48），“V-型法”为20.8%（10/48）。 2.全基因组微阵列芯片检测：全部120例病例均成功进行了全基因组高分辨率CMA技术检测。CMA结果提示共有13例病例含有致病性CNVs，其中产前诊断样本5例，外周血样本8例。致病性CNVs检出率为10.8%(13/120)，99例患儿含有良性CNVs，良性CVNs检出率为82.5%（99/120）；8例病例含有临床意义不明确的CVNs（VOUS），VOUS检出率为6.7%（8/120）。致病性CNVs在单纯性腭裂病例的检出率为5.6%（1/18），唇腭裂8.7%(5/57)，合并其它畸形33.3%(7/21)，而单纯性唇裂病例中未检测出致病CNVs。 3.全外显子组高通量测序15个样本测序数据质量，测序深度与覆盖度均达到可分析标准，每个样本外显子区检测SNV数目约19600个，Indel约550个。 4.5个家系15名受检者中，经过致病基因筛选共发现致病性突变1例，可能致病性突变2例，意义不确定6例，所有SNV均经Sanger测序证实。 5.经过minigeng验证，首次系统报道了IRF6基因剪切位点致病性新发突变。 结论：1.三维超声成像可以显著提高胎儿唇腭裂产前诊断的准确度，尤其在诊断腭裂比二维超声具有更大的优势。 2.高质量的三维容积图像的获取是准确诊断胎儿唇腭裂的关键，“翻转脸”法和“V-型法”在评价胎儿腭部的完整性上具有较高的临床应用价值。 3.全基因组染色体微阵列技术在先天性唇腭裂畸形病因学诊断具有重要应用价值，该技术与传统的G显带核型技术相比能将致病性C N Vs检出率提升至10.8%。 4.唇腭裂合并其他异常综合征型的致病性CNVs检出率显著高于单一唇裂、腭裂、唇腭裂的非综合征型病例（33.3%vs0%vs5.6%vs8.7%）。 5.外显子组测序对唇腭裂畸形的病因学诊断具有应用价值，全面检测致病突变，具有准确、高效的特点。