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线粒体异质性是指在一个个体内，存在多种线粒体单体型的现象。目前关于线粒体异质性的研究，主要集中在与人类疾病、年龄以及组织特异性的领域。在昆虫中有关线粒体异质性的研究比较少，主要研究焦点则聚焦在线粒体异质性状态，异质性的来源。然而很少有人关注线粒体异质性对分子鉴定的影响。 本研究以寄生于对叶榕的Ceratosolen solms(Agaonidae/Kradibiinae)，Apocrypta bakeri(Pteromalidae/ Sycoryctinae),Philotrypesis pilosa(Pteromalidae/Sycoryctinae),Philotrypesissp.,及寄生于垂叶榕的Eupristina koningsbergeri(Agaonidae/Agaoninae)，Philotrypesis sp.1，Philotrypesis sp.3，Philotrypesis sp.4，Philotrypesis sp.5，Walkerella benjamini(Pteromalidae/ Otitesellinae),Walkerellasp.1,Sycophilasp.1(Eurytomidae/Eurytominae),Sycophilasp.2,Sycobiasp.2(Pteromalidae/Epichrysomallinae),Sycoscaptersp.1(Pteromalidae/ Sycoryctinae),Acophilasp.1(Pteromalidae/ Epichrysomallinae),Ormyrussp.1(Ormyridae/ Ormyrus)为实验材料，研究了不同物种的线粒体COI基因异质性情况。新一代测序技术的出现，为生命科学的研究提供了极大的帮助，并将生命科学带入大数据时代。在研究线粒体异质性方面，新一代测序技术有着常规实验途径所不具备的巨大优势：检测低频异质性。我们通过罗氏公司的454测序平台，结合 mothur，Ultratranseq，Perl，CD-HIT等高通量数据分析软件，对榕小蜂的线粒体 COI基因进行了大数据分析。研究表明：⑴榕小蜂中，线粒体异质性现象十分普遍。我们检测到92.3％的个体内具有异质性，覆盖100%的实验物种。⑵传粉榕小蜂的线粒体异质性水平较低，不足以干扰分子鉴定的准确性。尤其是在Ceratosolen solmsi中，4个个体中仅有1个个体检测到线粒体异质性，而其他3个个体各自所获得COI序列完全一致，这说明Ceratosolen solmsi中存在微乎其微的线粒体异质性。⑶在具雄性多型现象的物种中，异质性情况因物种而不同。Philotrypesis属与Walkerella属的不同个体在两方面体现出高水平的线粒体异质性：1、次要单体型与主要单体型的K2P遗传距离大(甚至同一个体的COI片段汇聚类到不同的进化支上)；2、次要单体型所占比例高(次要单体型甚至占总序列数的71.8%)。尤其发现不同物种共享同一单体型，因而在使用COI对这两个属的物种进行分子鉴定时，需要格外小心。在Sycobia sp.2中，虽然次要单体型所占比例较小，但是由于次要单体型与主要单体型之间的遗传距离较大，因而也不能忽视次要单体型对分子鉴定的影响。在Sycophila sp.1和Sycophila sp.2中，所发现的异质性水平很低，COI片段可以很好地用于区分两个物种。⑷在Apocrypta bakeri、Acophila sp.1、Sycoscapter sp.1与Ormyrus sp.1四个物种中，情况也因物种不同而有差异。由于Acophila sp.1所得序列较少，难以得出可靠结果。在Apocrypta bakeri中，发现次要单体型所占比例以及其余主要单体型的遗传距离均比较小，不会对分子鉴定产生重要影响。Sycoscapter sp.1中虽然具有比较高的次要单体型比例，但是其与主要单体型的遗传距离不大，不会对分子鉴定等产生影响。在Ormyrus sp.1中，次要单体型与主要单体型的K2P遗传距离大，并且次要单体型所占比例高，因而在使用COI片段对该物种进行分子鉴定需要留意。