以34份甘薯种质（包括1份秘鲁品种、1份美国品种、9份日本品种和中国的18份地方品种及5份改良品种）为供试材料，应用形态标记和ISSR分子标记技术，探讨甘薯的遗传多样性。所得结果如下： 1．甘薯基因组DNA提取：本研究根据甘薯的特殊性，优化了适于甘薯基因组DNA的CTAB提取方法。 2．甘薯ISSR技术体系的构建：ISSR反应的体系为201μl；体系的反应程序为：94℃预变性5min；94℃45s，50-55℃1min30s，72℃1min30s，45个循环；72℃7min；10℃保存。 3．ISSR分子标记的PCR扩增：在34个供试材料中，15个ISSR引物共扩增出1663条带，其中有401条多态性带，多态性百分率为24.11％，平均每个引物扩增出26.73条多态性带。 4．甘薯品种的形态标记聚类分析：当第一等级D=6.54时34个品种分为两个类群（类群Ⅰ和类群Ⅱ），两个类群中都包含了地方品种、选育品种和外来品种。当第二等级D=4.45时，又可将类群Ⅰ分为Ⅰ₁、Ⅰ₂、Ⅰ₃、Ⅰ₄、Ⅰ₅和Ⅰ₆ 6个亚类（群），把类群Ⅱ分为Ⅱ₁、Ⅱ₂、Ⅱ₃和Ⅱ₄ 4个亚类（群）。 5．甘薯品种的ISSR分子标记聚类分析：当以第一等级D=0.34划分时，可以把34个品种划分为由30份品种组成的类群Ⅰ、两个品种组成的类群Ⅱ和两个由单一品种构成的个类（Ⅲ和Ⅳ）。当第二等级D=0.29时又可以把类群Ⅰ划分为6个亚类（Ⅰ₁、Ⅰ₂、Ⅰ₃、Ⅰ₄、Ⅰ₅和Ⅰ₆）。 6．形态标记和ISSR分子标记的相关性：形态标记与ISSR分子标记的相关性r=0.05，相关性极低，说明二者之间相关不显著。