新疆冷水鱼肠道耐低温乳酸菌分离鉴定及系统发育研究

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目的:在低温环境中生存的动物体肠道内共生着数目庞大、结构复杂的微生物群落,其中乳酸菌被公认为对宿主有着众多有益的作用,由于来源于低温环境中的低温乳酸菌相对生长温度范围较低,在生物保鲜中显示了极具潜力的应用价值。因此本文从新疆阿勒泰地区额尔齐斯河流域冷水鱼肠道中分离耐低温的乳酸菌,挖掘乳酸菌的物种和遗传多样性,为低温乳酸菌生物技术研发提供优良菌种,并完善我国自主的乳酸菌菌种资源库。方法:本实验用MRS、Elliker两种不同培养基对采自新疆阿勒泰地区额尔齐斯河流域9种冷水鱼肠道中的菌群进行分离,筛选出耐低温乳酸菌,测定细菌最适生长温度并进行常规生理生化实验。根据16S rRNA基因序列初步确定耐低温菌的系统进化地位,并采用BOX、(GTG)5、ERIC三种不同的引物进行rep-PCR,对16S rRNA基因高度同源性的菌株进一步区分。最后通过纸片法对分离菌株的药敏性进行了初步研究。结论:1本研究利用MRS、Elliker两种不同培养基从新疆阿勒泰地区额尔齐斯河流域9种冷水鱼肠道中,分离筛选出耐低温菌78株,形态学观察显示:耐低温菌株中有35株菌的菌落形态比较大,菌落直径大于5mm;有16株菌的菌落直径在1-5mm;27株菌的菌落直径在1mm以下。另外,大多数的耐低温菌株为乳白色,部分菌株也呈现出淡黄色,还有一部分菌株为白色透明。最后通过革兰氏染色和接触酶实验初步确定24株分离菌为疑似乳酸菌。2通过温度试验结果表明:24株菌其中有8株菌为嗜冷菌,16株为耐冷菌,通过生理生化和16SrDNA序列同源性分析显示24株耐低温乳酸菌隶属于6个属,其中肉杆菌属(Carnobacterium)3株,乳球菌属(Lactococcus)9株,肠球菌属(Enterococcus)7株,环丝菌属(Brochothrix)1株,魏斯氏菌属(Weissella)2株,链球菌属(Streptococcus)2株。3由BOX-PCR、ERIC-PCR、(GTG)5-PCR指纹图谱,可以清晰的看出耐低温乳酸菌指纹图谱产生的条带较多,能够反映不同菌株在基因组水平上的差异,指纹图谱聚类分析树状图显示,在70%的相似性水平上,所有菌株可以划分为6个群(Group),同时从树状图也可以清晰看到乳球菌属(Lactococcus)和肠球菌属(Enterococcus)存在种及菌株水平上的遗传差异,前者包括4个种,后者2个种。4本试验从不同来源的冷水鱼肠道内中分离并鉴定了24株乳酸菌菌株,进行11种常用抗生素药敏检测,结果表明:耐药率最高药物为链霉素(100%);敏感率最高药物是氨苄西林(100%),中介率最高药物则为青霉素(83.33%)。另外不同鱼肠道来源的耐低温乳酸菌药敏性也各不相同。
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