近年来,我国长江和黄淮海两个产棉区棉花产量逐渐下降,与此同时新疆棉花产量逐渐上升使得新疆的植棉责任进一步凸显。但是随着生产要素和劳动力成本的上升,以及自然天气的不确定性,使得棉花种植的最终收益存在很高风险,加之国家“减棉增粮”的农业大政策,使得新疆兵团棉花产业面临着诸多挑战。在此背景下,需要重新了解新形势下棉花的利润,农户种植棉花是有净收益还是发生亏损,棉花的要素成本比重,农民是否需要政策补贴,现行的棉花补偿政策是否合理等等。对这些问题的探索,将有利于新疆兵团棉花产业的持续健康发展。本文通过统计部门的数据和对植棉农户的调查数据,采用统计分析方法对新疆兵团棉花种植的成本与收益情况进行了详细研究,并同三大产棉区以及全国数据进行了比较,在成本收益分析基础上,对新疆兵团植棉职工的棉花国家补贴进行了机制分析。通过实证分析,得到了如下几点主要结论:(1)新疆作为我国棉花播种面积和产量最大的区域,新疆兵团是新疆植棉的最大区域。近几年,新疆兵团棉花播种面积规模及占全国比重持续增加,新疆兵团棉花产量及占全国比重持续上升,新疆兵团棉花单位面积产量也高于全国及新疆平均水平;(2)随着棉花种植人工成本的上升,新疆棉花种植业出现了亏损,但以阿克苏地区和本文调查对象为代表的新疆兵团仍然处于正效益状态。这主要源于新疆兵团植棉的两方面优势,一是单位面积产值高,二是成本低;(3)植保费、水费和滴管费对新疆兵团棉花收益存在正作用,人工费、机械作业费和地膜费对新疆兵团棉花收益存在负作用,其余成本项目对棉花收益作用不显著。(4)不同的师团的每亩净收益和家庭人均净收益相差较大,使得各师团的棉花补贴也不等。六师的每亩补贴额最高,一师一团补贴额最低。本文分析发现纯粹的目标价格补贴制会导致出现不公平现象,部分棉农会因为国家补贴而不去提高植棉效率,进而降低了整体的植棉效益。