许多物种处于濒临灭绝状态，如果我们不立刻采取有效的措施，我们将要永远失去这些物种。建立自然保护区来保护濒危物种已被各国所广泛应用，事实表明这是比较有效的方法之一。本文首先给出了一个确定性的生物保护区的模型，通过对模型的分析，我们得到：保护区确实有助于保护生物种群与生态环境，我们还给出了生物生长的危险域，参数域以及经典的关于平衡状态稳定性的分支曲线。基于这些结论，我们给出了提高保护区效果的措施。但是，在现实生活中，种群动力系统不可避免的要受到环境噪音的干扰，这也是生态系统的一个重要组成元素。本文用白噪声来代替环境干扰，并给出了一个随机的保护区模型。当我们将随机因素考虑在内时，保护区的效果如何？又有哪些因素会影响保护区的效果？通过对随机模型的研究，我们的结果说明了，在好的条件下，自然保护区的设立仍然可以保护生物种群，当条件比较差时，虽然保护区不能够消除种群灭绝的可能性，但是保护区能够减缓种群灭绝的速度，同样的，我们给出了几种增强保护区效果的方法，还给出了一种有利于生物持久生存的划分保护区的方法。另外，我们还给出了一些例子及数值模拟来解释我们的结论。