健康个体-结直肠息肉-结直肠癌中血清circRNA的表达模式

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目的:利用circ RNA芯片观察结直肠息肉-结直肠癌患者血清环状RNA表达谱变化,初步预测结直肠息肉恶性转化过程中血清circ RNA的动态表达模式,进一步筛选潜在候选基因,为探讨结直肠息肉-癌症发生发展机制提供证据。方法:1、收集了健康个体、结直肠息肉及结直肠癌患者血清样本各10例,其中三组各5例进行circ RNA芯片分析,另5例进行q RT-PCR验证;2、circ RNA表达谱芯片技术分析15例血清标本中circ RNA差异表达谱,进一步分析健康对照组-结直肠息肉组-结直肠癌组中差异表达的circ RNA;3、应用q RT-PCR验证筛选出的10个表达显著差异circ RNA在另外的健康个体、结直肠息肉及结直肠癌血清中的表达情况,验证芯片结果的可靠性;4、结合Target Scan和mi Randa数据库,对候选的10个circ RNA预测其可能结合的mi RNA。结果:1、通过circ RNA芯片技术,获得了健康个体、结直肠息肉、结直肠癌患者血清中差异性表达的circ RNA共2162个,其中,与健康个体相比,结直肠息肉组有52个circ RNAs上调,38个下调,结直肠癌组有64个circ RNAs上调,72个下调;与结直肠息肉组相比,结直肠癌组中有38个circ RNAs上调;2、从健康个体到结直肠息肉表达下降、结直肠息肉到结直肠癌表达上升趋势有circ RNAs 5个以及健康个体到息肉表达上升、息肉到癌表达下降的circ RNAs共33个;3、挑选出circ0001013,hsacirc0001907,hsacirc0005758,hsacirc0029431,hsahsacirc0000669,hsacirc0046188,hsacirc0053063,hsacirc0007422,hsacirc0003915,hsacirc000788310个潜在候选circ RNAs,进一步筛选验证了候选hsacirc0001013、hsacirc0005758及hsacirc0007422这3个circ RNA在健康对照组、结直肠息肉组及结直肠癌组的m RNA表达水平呈现升高、降低的趋势,与芯片结果一致;而hsacirc0053063则在结直肠息肉组及结直肠癌组的m RNA表达水平间有显著差异。4、预测差异表达的候选hsacirc0001013、hsacirc0005758、hsacirc0007422、hsacirc0053063和micro RNA之间的存在相互作用。结论:健康个体、结直肠息肉、结直肠癌患者血清circ RNA表达谱存在差异,hsacirc0001013、hsacirc0005758、hsacirc0007422、hsacirc0053063为circ RNA结直肠息肉、结直肠癌发生发展潜在候选基因。
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