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生境片断化对生态系统中物种的维持造成了严重的威胁,隔离形成的小种群面临着灭绝的危险。本文选择片断化典型地区—浙江省淳安县千岛湖东南湖区10个岛屿及周边地区为研究地点,研究共分为两部分内容,第一部分探究生境片断化对苔藓植物物种多样性的影响；第二部分采用ISSR分子标记和基因片段测序两种分子技术手段,选择在东南湖区有广泛分布的两种藓类植物大灰藓(Hypnum plumaeforme)和东亚小金发藓(Pogonatum inflexum)为实验材料,揭示该地区生境片断化发生50余年后两种藓类植物的遗传多样性水平以及种群间的遗传分化程度,研究结果如下：1)经过4次实地考察,获得苔藓标本1102份,经鉴定千岛湖东南湖区共有苔藓植物37科71属129种,其中苔类10科12属15种,藓类27科59属114种,发现浙江省新记录3种,即双色真藓Bryum dichotomum Hedw.、短枝高领藓Glyphomitrium(Mitt.)Cardot和细枝藓Lindbergia brachyptera (Mitt.)Kindb..区系成分以东亚分布为主,共43种,占总种数的39.45%,其次为北温带成分和热带亚洲分布,分别占20.18%和18.35%。2)通过对岛屿面积与苔藓植物物种分布的分析,129种苔藓植物中有58种受岛屿面积影响较大。只分布在大岛或中岛上的苔藓物种对环境较敏感,当生境面积减小到一定程度时,会面临灭绝的危险。3)各岛苔藓物种数量随岛屿面积的增大而增多,并逐渐趋于饱和。岛屿面积与物种丰富度存在联系,但不呈现简单的线性关系。当岛屿面积增大到一定数值后,其包含的生境类型基本与邻近陆地的生境达到一致,此时物种丰富度不再随岛屿面积的增大而增大,与周围陆地的丰富度趋于一致。4)ISSR研究结果表明：大灰藓14条引物共检测到111个位点,多态性位点98个,P=88.29％,HT=0.2581,Hs=0.1714,SI=0.4065,Nm=0.9889,rd:0.0223,GST=0.3358；东亚小金发藓12条引物共检测出117个位点,多态性位点114个P=97.44％,HT:0.2832,Hs=0.2120,SI=0.4296,Nm:1.4879,rd=0.00683,GST=0.2515。东亚小金发藓总体的遗传多样性高于大灰藓。两种藓类的遗传变异主要存在于种群内(大灰藓=66.42%；东亚小金发藓=74.85%)。大灰藓种群和东亚小金发藓种群分化程度均较低,基因流较高,能够抵抗因遗传漂变而产生的不利影响,基因流是维持遗传结构的主要因素。经Mantel检验,东亚小金发藓种群的遗传距离和地理距离之间存在显著正相关关系(r=0.3342,P=0.0180<0.05),而大灰藓种群则不存在相关性(r=0.1099,P=0.1760)。5)基因片段测序结果显示大灰藓叶绿体基因atpB-rbcL间隔区和叶绿体基因rps4有信息位点,atpB-rbcL间隔区存在1个突变点和10个空位,rps4只有一个突变点,基于atpB-rbcL和rps4共有5种cpDNA单倍型。东亚小金发藓叶绿体基因rps4及核基因Leafy有信息位点,rps4中有3个突变点,Leafy有26个突变点,基于rps4和Leafy,共有9种单倍型,有限的突变点暗示了岛屿种群和周边地区种群基因交流较频繁,受到水域隔离的影响小。