鳙是我国重要的养殖鱼类。然而在环境变化及人类活动的影响下，鳙自然资源衰退严重，同时，长期的人工养殖也导致鳙生产性状发生衰退。开展遗传学及基因组学研究对鳙种质资源保护与品种改良具有重要理论和实践意义。本研究针对鳙群体遗传学分析和基因组作图，开展了以下研究工作:　　 利用9个核微卫星标记(SSR)和3个线粒体DNA(mtDNA)标记分析了5个长江鳙群体和2个养殖群体的遗传结构。结果显示，与野生群体相比，养殖群体已有明显的遗传多样性丧失;野生群体间存在明显遗传分化，且群体间亲缘关系和地理距离具有一定关联性。利用20个鲢、鳙种间特异性SSR标记、8个多态SSR标记和4个mtDNA标记分析了采自美国密西西比河和伊利诺斯河167个鲢、鳙样本，发现前者有30％鲢、鳙遗传渐渗个体，而后者渐渗比例高达61.4％，同时，通过mtDNA分析也发现了线粒体渐渗的证据。对我国长江流域14个采样点504尾鲢和496尾鳙样本的分析结果表明，7.3％鲢和3％鳙为种间渐渗个体，说明在我国也存在一定比例的鲢、鳙遗传渐渗现象。本研究结果为开展鳙野生资源评价和纯种保护、繁育种群的遗传评估和亲本选择具有重要理论意义和参考价值。　　 利用754个SSR标记，采用虚拟测交策略以鲢、鳙间正、反交家系各77个F1子代为作图群体，分别构建了鳙第二代雌、雄及性别平均遗传图谱。图谱包含659个SSR，分布于24个连锁群上，连锁群数和鳙单倍体染色体数相等;图谱长1917.3 cM，覆盖92.8％的鳙基因组;图谱标记间平均图距为2.9 cM。雌、雄同源连锁群间存在标记位置重排现象，雌、雄性图谱间重组率之比为1.10∶1。通过鳙图谱与斑马鱼基因组比较作图定位了152个同源基因的位置;通过与其他9种鱼类基因组比较，发现硬骨鱼类在进化过程中既存在基因的保守进化又存在普遍的染色体重排。本研究结果为鳙物理图谱组装、图位克隆、染色体和基因组进化、数量性状位点定位及分子标记辅助育种等研究奠定了良好基础。　　 从鳙第二代遗传图谱中选取103个SSR位点在6个鳙减数分裂雌核发育二倍体家系中进行了半四分子分析，结果显示，各标记与着丝粒间的重组率介于0-0.91之间，其中16.5％的位点检测出高重组率(＞0.67)，说明鳙染色体中存在交叉干涉现象。根据完全干涉法计算出各标记到各自着丝粒的遗传距离介于0-45.5cM之间，并将所有24个连锁群的着丝粒定位于95％的置信区间内，发现24个连锁群上着丝粒的位置与先前报道的鳙染色体组型基本吻合。　　 克隆得到了鳙摄食调控基因ghrelin的cDNA和DNA全长，基因全长1015bp包含4个外显子和3个内含子，组织表达分析显示，ghrelin在鳙肠道表达量最高。在鳙ghrelin中发现3个多态性SNP位点:g.162C＞A、g.163 C＞A和g.540G＞T，但在4个鳙群体中各SNP位点基因型与体重、体长、头长、体高及肥满度5个生长性状间均无显著相关性。