随着科技事业在全球范围内的飞速发展以及各国间在科学技术领域日益激烈的竞争,各国政府对科技活动的重视度得到了极大的提高,国家对科研领域的经费投入也持续增加,科技经费支出在国家财政总支出中的比例逐年上升。2007年,国务院经过审议颁发了《中央企业财务预算管理暂行办法》,规定科研工作实施分项目的全成本核算、全额预算以及过程控制,并将上述几种管理模式进行有机结合,提高专项科研经费管理模式的科学性。随着我国财政预算制度改革以及机构体制改革的不断深入,科研事业单位以往粗放式的经费管理模式已经难以适应形势发展的需要,建立一套科学、合理的科研单位预算管理模式已经成为科研机构需要解决的当务之急。全面预算属于一种现代化的管理模式,在机制、体制以及具体操作方面都提出了人本化、战略化、全员性、全面性以及系统性的现代化的企业管理方法,对企业或者组织单位产生较强的约束力与控制力,具有非常重要的作用。通过对已有的研究资料进行查阅分析可以发现,前人的研究大多数集中在企业全面预算管理的应用,鲜有涉及事业单位。已有的少数理论研究成果中,虽然涵盖了全面预算管理的多个方面,但多数仍以全面预算管理的理论研究为主,研究的对象也较少涉及科研单位,以具体科研单位的全面预算管理应用为案例进行的研究成果更是匮乏。本文运用了全面预算管理理论,并结合了H研究院的具体情况以及全面预算管理实施情况进行了案例分析,侧重于对科研事业单位在实施全面预算管理制度方面的实践研究,具有一定的理论和现实意义。本文首先对研究的背景和意义进行了阐述,明确本文研究的可行性和必要性,从全面预算管理、事业单位预算管理研究、科研事业单位研究三个角度对该问题当前的研究现状进行了文献综述;其次对科研事业单位全面预算管理的理论进行了简述,包括全面预算管理的涵义,科研事业单位全面预算管理的特殊性,我国科研事业单位全面预算管理发展的历程,科研事业单位全面预算管理中的业务预算、财务预算、资本支出预算内容和遵循的代理理论、权变理论、控制理论等理论基础;第三,分析了H研究院全面预算管理的特殊性、总体思路、实施原则、管理内容等实际情况,指出了H研究院全面预算管理意识薄弱、预算编制缺乏科学性和合理性、全面预算考虑不全面、预算执行力不足、忽视全面预算执行结果等存在的问题;第四,结合H研究院全面预算管理中存在的具体问题,分析了导致问题的原因在于缺乏全面预算管理氛围、预算管理组织不完善、预算编制方法落后、缺乏预算执行督促、缺乏考核和管理机制等;最后,运用全面预算管理的相关理论,针对H研究院全面预算管理存在问题的原因,提出了营造全面预算管理氛围、强化全面预算的战略指导、科学编制全面预算、提高全面预算执行力、建立全面预算预警机制、健全全面预算考核机制等对策建议。