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目的： 宫颈癌是最常见的妇科肿瘤之一，在女性中发病率仅次于乳腺癌，其发病机制主要是高危型人乳头瘤病毒(hrHPV)的持续性感染引起，目前也已经有很多研究发现了包含人乳头状瘤病毒整合的基因位点，但是，促使宫颈癌肿瘤形成的关键基因目前还不明确。通过这篇文章，我们有望找到宫颈癌发生发展的关键致病基因，从而提出了一种新的生物信息学策略，旨在为将来的宫颈癌的治疗和预防提供新的依据。 方法： 我们通过对6例HPV相关宫颈癌病人组织标本及其配对的正常宫颈组织进行全转录组mRNA, miRNA 和长链非编码RNA (lncRNA)分析，筛选出400个不同表达又有研究证明和HPV整合相关的基因，并对这些差异表达的基因进行GO功能注释， KEGG通路分析，了解这些差异基因主要参与的生物学功能及通路。接着，我们再通过TCGA数据库挑选出与预后相关的9个基因：RUNX1T1, RHOB, ANO4, CASP3, IFIH1, C6orf145, C4orf32, TFRC和AR，这些基因的表达均和宫颈癌的生存率相关。然后，通过对这些基因进行mRNA, miRNA和lncRNA的共表达网络分析，找出与这些mRNA, miRNA 和lncRNA联系最密切的基因。 结果： 我们通过对6对HPV相关宫颈癌组织标本及其配对的正常宫颈组织进行全转录组mRNA, miRNA和长链非编码RNA (lncRNA)分析后，共筛选出了1953个差异表达的基因，在其中选出了400个与HPV整合相关的基因。通过对这400个差异基因的GO功能注释和KEGG通路分析后，我们发现这些基因参与了许多与癌症进展相关的生物学进程，进一步验证了HPV整合相关重叠的这400个差异表达的基因与癌症发展的通路有着密切的关系。接着，我们进一步结合TCGA数据库的生存曲线分析筛选出9个与宫颈癌总体生存率相关的9个基因：RUNX1T1,RHOB, ANO4,CASP3,IFIH1, C6orf145, C4orf32, TFRC和AR。而在这9个基因中， RUNX1T1与其他的mRNA, miRNA和lncRNA联系最密切，该基因与染色体重塑相关，这也说明了RUNX1T1在宫颈癌发生发展中可能有着重要的作用。 结论： 我们通过这篇文献，挑选出了9个与宫颈癌患者总体生存率相关的基因：RUNX1T1, RHOB, ANO4, CASP3, IFIH1, C6orf145, C4orf32, TFRC和AR，更重要的是，提出了一个新的可能在宫颈癌发展中有着至关重要作用的基因RUNX1T1，而该基因RUNX1T1将来也可作为宫颈癌预后标志物或是作为药物治疗的靶点。