普通×爆裂玉米群体单性状及多性状联合QTL分析

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爆裂玉米是一种专门用来制作玉米花系列休闲食品的特用玉米类型。由于爆裂玉米种质资源较少,严重着制约育种水平和效率的进一步提高。随着分子标记技术的发展,高密度遗传图谱的构建,在玉米数量性状基因定位方面已经取得了一定的进展。本研究以优良爆裂玉米自交系N04与普通玉米丹232杂交构建259个F2群体及F2:3家系,利用SSR分子标记构建高密度遗传图谱,采用复合区间作图法,以排列测验1000次所得LOD值作为阈值,对爆裂玉米的3个膨爆特性指标、9个穗粒性状、9个植株性状和4个籽粒营养品质进行了两个环境的合并QTL定位和效应分析,采用多区间作图法分析QTL间的上位效应,并采用多性状联合分析的复合区间作图法对膨爆特性指标间、穗粒性状间、籽粒营养品质性状间、主要植株性状间以及膨爆特性与主要穗粒性状间进行了多性状QTL联合分析,探讨各性状的分子遗传机制及其间的遗传关系,判断控制相关性状QTL存在的一因多效性或基因紧密连锁,同时验证以往相关研究结果。为进一步开展分子标记辅助选择、QTL精细定位及其克隆提供更为可靠的理论依据。 本研究主要得到以下结论: 1.用613对SSR引物对两个亲本N04和丹232进行多态性检测,获得193个共显性标记位点,占31.48%。利用Mapmaker3.0作图软件和183个共显性SSR分子标记构建了一张爆裂玉米分子标记连锁图,图谱总长度为1762.2cM,相邻两标记间的平均距离为9.63cM。 2.3个膨爆特性指标单独分析共检测到16个QTL,单个QTL贡献率为4.85%~15.39%,控制不同膨爆特性指标的QTL具有相同的标记或置信区间,部分显性、超显性、加性对膨爆特性的遗传均起着主要的作用;部分定位QTL间存在较大的互作效应;控制不同膨爆特性指标的QTL多数表现为一因多效。 3.9个穗粒性状单独分析共检测到26个QTL,单个QTL贡献率为4.66%~22.96%,部分穗粒性状QTL具有相同的标记或置信区间,表现为热点分布,部分显性效应对穗粒性状的遗传起着主要作用;定位QTL间互作较少,而且效应较小;在第2、5、10染色体上控制穗粒重和百粒重的QTL,在第10染色体上控制穗粒重和穗行数的QTL以及在第2、7、8染色体上控制穗粒重和行粒数的QTL存在为一因多效性或紧密连锁。 4.穗粒重和百粒重与膨化倍数呈极显著负相关,其QTL联合分析表明百粒重与膨化倍数在第1染色体上、穗粒重与膨化倍数在第2、8染色体上LOD曲线的峰点表现同向变化,存在QTL紧密连锁或一因多效。 5.4个籽粒营养品质性状单独分析共检测到15个QTL,单个QTL贡献率为4.95%~10.57%,加性和部分显性效应均对籽粒营养品质的遗传起着主要作用;定位QTL间互作较少,而且效应较小;大多数控制淀粉含量和蛋白含量的QTL存在一因多效或紧密连锁。 6.9个植株性状单独分析共检测到39个QTL,单个QTL贡献率为4.25%~31.44%,加性和部分显性效应对植株性状遗传起着主要的作用;定位QTL间互作较少,而且效应较小;
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