略阳乌鸡不同生长时期脾脏转录组学分析及免疫相关基因筛选

来源 :陕西理工大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:zuguangle
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究在测定略阳乌鸡体重、脾脏重量等生长性状及鸡脾脏发育状况的基础上,运用转录组测序和生物信息学分析技术鉴定差异表达基因和影响脾脏发育的关键基因,旨在进一步发掘略阳乌鸡生长脾脏发育与免疫相关基因及相关通路,探索其内在分子机制。选取7日龄、30日龄和120日龄且饲养条件相同的略阳乌鸡各3只。测量体重和脾脏重量,收集脾脏组织,利用石蜡切片对脾脏发育进行组织学分析,利用RNA-seq技术对略阳乌鸡脾脏组织进行转录组测序,分析基因表达模式。主要结果如下:1.脾脏组织学观察:7日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞和淋巴鞘开始产生,30日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞数量和淋巴鞘数量更多,形态趋于稳定,120日龄略阳乌鸡脾脏与30日龄相比无显著差异。2.转录组测序筛选差异表达基因:通过转录组测序发现7日龄与30日龄相比差异表达基因340个;30日龄与120日龄相比差异表达基因174个;7日龄与120日龄相比差异表达基因1100个。三组对比共同差异表达基因17个。3.差异表达基因GO、KEGG分析:7日龄与30日龄差异表达基因主要富集在外部刺激反应、白细胞迁移、细胞趋化性、粒细胞迁移和防御反应等与免疫相关的条目。30日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞趋化作用、白介素-1的调节、外部刺激反应、细菌防御反应和趋化因子受体结合等与免疫相关的条目。7日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞周期、有丝分裂核分裂、染色体的浓缩、着丝粒和纺锤体微管等与细胞分裂相关的条目。此外,三组间对比的差异基因均富集到了造血细胞谱系信号通路、神经活性配体受体相互作用信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路。4.权重基因共表达网络分析:构建了与性状相关联的权重基因共表达网络,筛选出与鸡生长发育相关的关键基因有:EVL、FGD3、TNIK、QRICH1、ZYX、TBL1X、IFT80、SF3B1、CEPT1、MYH9、POLH和MICAL1;影响略阳乌鸡免疫功能的关键基因有:EVL、VAV3、TNIK、NLRC3、IL2RB、RPS25、WBP1L、DDX17、ABHD10、PON2、FANCD2和CD3E。
其他文献
<正>念珠菌性阴道炎,即外阴、阴道假丝酵母菌病,是一种能发生于妇女一生中任何年龄的疾病,且30~40岁为发病的高峰[1]。其特点为围绕月经期反复发作,缠绵难愈。哺乳期是女性的
第一部分自噬应激参与了多巴胺能神经元的损伤机制目的构建C57BL小鼠1-甲基,4-苯基,1,2,3,6-四氢吡啶(1-methyl–4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine,MPTP)急毒模型,观察帕金森病(Par
我国改革开放三十多年来,正处在城镇化发展的关键时期,要使我国较快较好地完成这个过程,很有必要对这一问题进行理论探讨和结合国内外经验进行分析总结,为灾后重建提供理论依
介绍了发展观光农业的意义,阐述了西安市长安区观光农业的发展现状,指出了其发展中存在的问题,并提出了发展对策,以促进西安市长安区观光农业的进一步发展。
众所周知体育教育专业的发展紧紧围绕学校教育目标和社会的需要而不断的进行改革和完善。如今在体育教育改革中,人们对教学体制进行了更深入的研究,对教学方法进行了与时俱进
研究目的:探讨自制冰敷袋对于人工全膝关节置换术(Total Knee Arthroplasty, TKA)的患者术后引流量、疼痛、肿胀和关节屈曲角度的影响。研究方法:本研究选择2011年1月至2012年1
金融业是经济活动的中心,随着信息科技的发展,银行、证券等金融公司在伦敦金融城的聚集程度一直在下降,取而代之的是住宅和零售店,因此金融产业集群并不一定是一个正确的方案
多数医家认为HIV/AIDS常侵袭肾、脾、肺三脏,而对肝在本病发生发展过程中的作用重视不足。"肝为将军之官",肝气冲和条达,不致遏郁,则气血得畅,脏腑阴阳功能协调;相反,肝气虚
本研究利用微生物发酵产酶的技术,在研究并优化地衣芽孢杆菌液态发酵产蛋白酶的工艺条件的基础上,将试验结果获得的优化条件发酵培养地衣芽孢杆菌产生的蛋白酶用于降解南极磷