种群遗传结构是进化生物学研究的核心问题。自然界中,同一物种的个体通常因为地理位置、生态环境和行为模式等方面的差异归属于不同的群体。群体之间通常会形成一定的遗传分化,并形成特定的遗传结构模式。扩散和基因交流是影响种群分化程度和种群遗传结构模式的最重要因素之一。频繁的基因交流会减小种群间的遗传分化。种群遗传结构的研究不仅可以帮助了解种群或物种的进化历史,评估其进化潜力,还可以为该物种的生态学、行为学等研究提供遗传背景依据。中华蟾蜍是一种广泛分布于我国并适应多种生态环境的两栖物种,在其繁殖行为、生活史和遗传背景等方面已经有了一定的研究,但是,因为样本的限制,目前还没有针对中华蟾蜍种群遗传结构的系统研究。本研究共采集了中华蟾蜍20个地理种群的样本,采用两种分子标记——线粒体 DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)标记和微卫星 DNA(microsatellite DNA)标记,分析其种群遗传结构以及扩散模式,得到如下的实验结果:(1)通过分析20个种群的110个样品的ND2基因片段,110个样品中线粒体单倍型数目为47个,平均单倍型多样性为0.971,平均核苷酸多样性为0.03989;分析微卫星位点的遗传多样性发现,20个种群六个微卫星位点的平均等位基因数目为12.83,平均观测杂合度为0.567,平均多态信息含量为0.750,平均期望杂合度为0.772;结果表明,所选20个中华蟾蜍地理种群的遗传多样性丰富。(2)分析中华蟾蜍种群遗传分化程度发现,基于线粒体数据得到,P值显著的FST值范围是0.1791-1.0000,P值显著的基因流的范围是0.0000-1.1456,基于微卫星数据得到P值显著的FST值的范围在0.0516-0.6353,P值显著的基因流数值范围在0.1435-4.5950,大部分种群间的遗传分化明显。(3)基于线粒体数据构建的NJ树显示20个地理种群被分成了 4个遗传群组,这与基于微卫星数据的聚类分析结果大体一致,分为云贵高原区域、闽南山系区域、中部区域以及东北和西南区域,其中有些地理种群存在于多个分类中,说明这些种群的遗传背景较为复杂。(4)分析20个地理种群间(163对)线粒体DNA和微卫星DNA数据中显著的成对遗传分化指数(FST)和基因流(Nm),微卫星成对比较的FST遗传分化指数绝多数小于线粒体FST遗传分化指数,并且微卫星总FST遗传分化指数也显著小于线粒体总FST遗传分化指数;另外微卫星成对比较的Nm值绝多数也大于线粒体Nm值,结果表明,中华蟾蜍可能为偏雄扩散。这一扩散模式影响了其种群遗传分化。本研究以中华蟾蜍为研究对象,对中华蟾蜍的种群遗传结构进行系统研究,并了解扩散对其种群遗传分化的影响。为两栖类的种群结构及扩散模式研究提供案例,为两栖类种群保护和栖息地保护提供理论支持。