为了探究水稻耐盐和耐碱的遗传机理,分析不同浓度盐、碱胁迫下水稻芽期和苗期的遗传效应和数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)。本试验以优质籼稻中优早8(ZYZ8)为父本,耐盐碱粳稻龙稻5(LD5)为母本构建的重组自交系群体(Recombinant Inbred Lines,RILs)为试验材料,采用营养液水培的方法,在芽期和苗期分别设置对照和不同浓度的盐、碱胁迫,分别进行表型鉴定、构建遗传图谱并进行相关性分析和QTL定位,主要研究结果如下:1.在盐、碱胁迫下,亲本和重组自交系群体的生长受到抑制,发芽势、发芽率、苗高、根长、根数、和干物质重都显著降低,死叶率、死苗率以及发芽势和发芽率的相对盐碱害率均显著升高,且随着胁迫浓度的增加,抑制也随之增强。母本龙稻5在盐、碱胁迫下各性状表型值变化幅度均小与父本中优早8,表现出较强的耐盐性和耐碱性。2.在盐、碱胁迫下,重组自交系群体芽期和苗期的耐盐、耐碱相关指标的平均值变异范围都较大,存在超亲分离的现象。群体的偏度和峰度值多小于或接近于1,多数性状符合或接近于连续正态分布,符合数量性状的遗传特性。3.在盐胁迫下,苗高与根数、死叶率与死苗率均存在极显著正相关,而死叶率(10d)与苗高和干物质重成极显著负相关。在碱胁迫下,苗高与根数和干物质重成极显著正相关,与死叶率和死苗率成显著或极显著负相关。死叶率与死苗率成极显著正相关,而干物质重与死叶率和死苗率存在极显著负相关。4.在盐胁迫下,在芽期,共检测到23个QTL,分布在第1、2、3、4、6和12号染色体上,LOD值在2.55~6.44范围内,表型贡献率的变化范围为7.40%~45.6%,其中主效QTL有6个。在苗期,共检测到8个QTL,分别分布在第1、4、6和7号染色体上,在第3号和6号染色体发现了4个新的有关发芽势、死叶率和死苗率的QTL位点(qSGE3a、qSGE3b、qSDLR6、qSDSR6)。5.在碱胁迫下,在芽期,共检测到21个QTL,分布在第1、2、3、4、7和12号染色体上,LOD值在2.79~10.58范围内,表型贡献率的变化范围为5.68%~17.62%,其中主效QTL有7个,分别是qAGE3a、qAGE3b、qAGR1、qARL3b、qARN3a、qARN3b和qADW2a。在苗期,共检测到5个QTL,分别分布在第1、2和6号染色体上。其中主效QTL有1个。在第4号染色体上与发芽率相关的QTL(qAGR4a),以及位于第6号染色体上与死苗率相关的(qADL6)是新发现的QTL。6.检测的耐盐或耐碱相关性状的位点存在成簇分布的现象,在盐胁迫下,在第2号染色体RM13603-ID4区间和第3号染色体的R3M10-STS区间各存在1个QTL簇,分别包含3个QTL和5个QTL;在碱胁迫下,在第2号染色体RM1358-RM300区间和第3号染色体的RM5480-STS区间各存在1个QTL簇,分别包含3个QTL和7个QTL;在盐、碱两种胁迫下,在第3号染色体的RM5480-STS区间的QTL簇均被检测到,推测在这个区间内的QTL可能存在着紧密连锁,或者由同一基因控制,也可能是由于控制不同QTL的基因存在相关性等原因所导致的,需要进一步研究。