二叠纪末生物灭绝事件是生物史上最大规模的灭绝事件，以二叠系-三叠系界线碳同位素化学地层学为代表的碳循环标志，由于其与古生态和古环境等的密切关系，一直以来备受关注。本文利用同位素数据及地层资料，研究了上扬子区3个剖面的二叠系-三叠系界线与其附近广泛出露的微生物岩。　　 本文研究剖面分别是四川通江红鱼洞北剖面，龙湖洞剖面和江油鱼洞子剖面。这些剖面分别位于四川东北部及中西部，属上扬子地区，同时也是我国的主要产气区。通过对这三个剖面的野外考察、样品采集，以及严格的样品选择和室内处理，并分析了样品的碳、氧同位素数据。根据δ13C和δ18O的相关性，即R2值判断样品的风化程度和碳同位素数据的可靠性，对比并参考全球δ13C在该界线附近的特征变化，根据这三个剖面的δ13C在剖面上的演替特征，我们初步认为二叠系-三叠系的界线置于微生物岩的底部比较合适，也就是说和长兴组与飞仙关组的岩石地层界线一致。　　 该地区很多剖面的二叠系-三叠系界线附近，都有微生物岩发育，出露良好。鉴于生物灭绝后可供剖面研究的生物地层资料缺乏，因此微生物岩也许可以提供进一步的事件和古环境信息。鉴于常规的岩石薄片研究中放大倍数的限制，有些更小尺度的生物痕迹很难得到研究，为此，本文选择了微生物岩典型发育的红鱼洞北剖面，利用不同的化学试剂和方法(如盐酸、氢氧化钠、EDTA、醋酸等)处理微生物岩样品，以使样品中不同成分的表面特征更加显著以利于纳米级研究的扫描电镜观察。我们发现，微生物岩内部有微米级和纳米级的生物痕迹特征，比如可能与硫酸盐还原菌相关的草莓状黄铁矿，可能和形成天然气有关的微生物成因的球状纳米级磁铁矿等等。通过对比实验和重复实验，我们发现，这些微米纳米级的生物痕迹特征只出现在剖面上的特殊层位，而与实验方法和背景污染无关。