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RecQ家族解旋酶属于SF2解旋酶超家族,对基因组稳定性的维持起着非常重要的作用。Bloom综合症、Werner综合症和Rothmund-Thomson综合症分别是由人类RecQ解旋酶3个成员BLM、WRN和RecQ4的功能缺失导致的,表现为多种严重的癌症症状。RecQ解旋酶解旋机制的大量研究,将为RecQ解旋酶作为抗癌药物靶的研究提供全新的思路。RecQ5解旋酶是人类5种RecQ家族解旋酶中的一员,人体细胞内RecQ5至少存在3种异构体RecQ5α、RecQ5β和RecQ5γ。RecQ5β全长包含991个氨基酸,包括解旋酶结构域和一个RQC结构域,还含有一个较长的与其它RecQ解旋酶没有同源性的C-末端区域。RecQ5β不仅能够解旋双链DNA结构,而且具有介导两条互补单链DNA分子退火的活性。尽管人们对解旋酶的研究已经比较广泛,但是目前RecQ5的生化特性及其在生物体内的功能仍不清楚。BLM全长1417个氨基酸,在溶液中能够以多聚体的结构存在,但是其解旋机制有待进一步研究。本研究对于深入了解RecQ家族解旋酶的作用机制,探索其生物学功能具有重要意义。本研究结合快速反应停流技术(stopped-flow method)和荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)的方法,系统的研究了RecQ5β的DNA退火和解旋动力学特性以及BLM的解旋活性。主要取得以下结果:1.在空状态和0.1mM磷酸核苷因子ADP、ATPγS和AMPPNP存在四种状态下,分析了随RecQ5β解旋酶浓度变化的RecQ5β对2nM两条互补的45-nt单链DNA底物的退火动力学过程。并对所有的退火动力学曲线进行双指数或三指数拟和,得到在四种状态下随RecQ5β浓度变化的退火初始速率。结果表明:(1)RecQ5β在四种状态下催化的退火反应在1020nM之间都有一个最适解旋酶浓度。(2)在四种状态下的最大初始退火速率基本相同。这与以前的研究结果不同。以前的研究认为,ATPγS和ADP能够完全或者部分抑制RecQ5β的退火活性。(3)在空状态和有磷酸核苷因子ATPγS存在状态下,RecQ5β催化的退火效率有比较宽的浓度变化范围,而在磷酸核苷因子ADP存在状态下,RecQ5β催化的退火效率其浓度变化幅度比较小。另外,定义了一个RecQ5β能够催化高效的退火反应时的有效的RecQ5β解旋酶浓度范围,在空状态和有磷酸核苷因子AMPPNP、ATPγS和ADP存在四种状态下,这个浓度范围分别为:5.6-27.7nM、9.8-24.1nM、4.9-33.8nM和11.5-19.3nM。2.通过偏振荧光的测量,分析了空状态和在0.1mM磷酸核苷因子ADP、ATPγS和AMPPNP存在四种状态下,一定量的RecQ5β解旋酶依次连续滴定到8nM3’F20-nt单链DNA底物的稳态结合动力学过程。结果表明,在四种状态下,RecQ5β解旋酶浓度较低时,偏振值随着RecQ5β解旋酶浓度的升高而升高。随后,RecQ5β解旋酶浓度较高时,偏振值不再升高,达到饱和。由于偏振值的变化反应单链DNA底物被结合在其上的RecQ5β解旋酶分子覆盖的程度,所以在RecQ5β解旋酶浓度较低时,单链DNA底物仅部分被RecQ5β解旋酶所覆盖;而RecQ5β解旋酶浓度较高时,RecQ5β解旋酶几乎完全覆盖单链DNA底物。并且,结合前面退火动力学分析中给出的有效的RecQ5β解旋酶浓度范围,在四种状态下,RecQ5β能够催化高效的退火反应时,RecQ5β解旋酶覆盖单链DNA底物的程度分别为:39.4%22.8%(空状态)、37.3%14.0%(AMPPNP)、37.8%26.3%(ATP S)和49.1%9.9%(ADP)。因此,RecQ5β解旋酶覆盖单链DNA底物大约40%-50%时,RecQ5β解旋酶能够催化高效的退火反应,而无论磷酸核苷因子存在与否。3.通过测量偏振荧光的方法,分析了(空状态和在0.1mM磷酸核苷因子ADP、ATPγS和AMPPNP存在四种状态下)在不同磷酸核苷因子存在状态下,100nM RecQ5β从10nM3’F20-nt单链DNA底物上的解离动力学过程。在空状态和AMPPNP与ATPγS存在三种状态下,RecQ5β从3’F20-nt单链DNA底物上解离的过程相似,都由一个快过程和一个慢过程两个过程组成。在ADP存在状态下,RecQ5β从3’F20-nt单链DNA底物上解离的过程只有一个过程。对所有的解离动力学曲线进行单指数或双指数拟合,得到空状态和在AMPPNP和ATPγS存在三种状态下的慢过程的解离速率和在ADP存在状态下的解离速率。结果表明,在ATPγS存在状态下,RecQ5β与ssDNA底物结合的最为紧密;而在ADP状态下,RecQ5β与ssDNA底物的结合最弱。空状态和在AMPPNP存在状态下,RecQ5β和ssDNA底物的亲和力相似。4.采用非互补的F和H标记的ssDNA底物进行退火动力学的分析。发现空状态和在ATP S存在状态下,荧光信号的变化较以互补ssDNA为底物的反应显著减小。充分说明在本研究中荧光信号的变化不是由于在RecQ5的作用下一些ssDNA分子的简单聚集,而是由于dsDNA的形成而造成的。结果表明本研究方法能够真实的反映RecQ5催化的ssDNA退火的动力学特性。5.采用另一种反应缓冲液体系:20mM Tris-acetate,pH7.9,50mM KOAc,10mMMg(OAc)2,1mM DTT和50mg/ml BSA,分析RecQ5的退火动力学特性。发现ATP S能够抑制RecQ5催化的退火反应。结果表明本研究方法能够真实的反映ssDNA的退火过程。6.在空状态下,比较分析了RecQ5β的C-末端缺失解旋酶片段RecQ5β1-662的随解旋酶浓度变化的退火动力学过程、稳态DNA结合动力学过程和解离动力学过程。退火动力学结果表明,RecQ5β1-662的最大初始退火速率比RecQ5β解旋酶全长低很多,前者大约为3%s-1,后者大约为30%s-1,低大约一个数量级。同样,可以得到RecQ5β1-662的有效的解旋酶浓度范围为4.6-16.3nM。由稳态DNA结合动力学分析可以得到,在空状态下,RecQ5β1-662能够催化高效的退火反应时,RecQ5β1-662覆盖单链DNA底物的程度为52.9%23.3%。这个结果表明,同RecQ5β解旋酶全长一样,当RecQ5β1-662覆盖单链DNA底物大约一半时,RecQ5β1-662能够催化高效的退火反应。该有趣的现象是否也存在于RecQ家族解旋酶的其它成员中,值得将来进一步研究。解离动力学结果表明,同RecQ5β解旋酶全长一样,在空状态下,RecQ5β1-662从3’F20-nt单链DNA底物上解离的过程由一个快过程和一个慢过程两个过程组成。其中,慢过程的解离速率为0.450.04S-1,基本同RecQ5β解旋酶全长在空状态下慢过程的解离速率一样,为0.510.12s-1。因此,尽管RecQ5β解旋酶全长与RecQ5β1-662对单链DNA具有几乎相同的亲合性,但这两个解旋酶的退火效率却相差很大。表明RecQ5β的退火活性,并不仅仅简单的决定于其与单链DNA底物的结合能力,而由特定结构所决定的解旋酶的内在特性也是非常重要的决定因素。进一步阐明了RecQ5β的C-末端区域是其催化高效退火反应所必不可少的。7.选择RecQ5β1-467和RecQ5β1-662两个RecQ5β解旋酶片段,确定了RecQ5β解旋的单转换动力学实验条件:以2nM双链部分长度为16-bp、带有不同长度(10-50nt)3’-尾链的ss/dsDNA为底物,温度为37°C、蛋白诱捕试剂dT56的浓度为2μM、ATP的浓度为1.5mM、RecQ5β的浓度为100nM。另外,对于较长的解旋酶片段RecQ5β1-662,DNA trap的浓度为2μM。8.在上述确定的单转换动力学实验条件下,通过对RecQ5β解旋酶N-末端三个氨基酸片段:RecQ5β1-467、RecQ5β1-567和RecQ5β1-662随不同3’-尾链长度DNA底物解旋动力学特性的研究和比较发现,该三个RecQ5β解旋酶片段的解旋幅度和解旋速率随着DNA底物3’-尾链长度的增加而增加,RecQ5β1-467的最高解旋幅度达到73.5%,RecQ5β1-567可达57.6%,而RecQ5β1-662则低于35.5%。即随着解旋酶氨基酸片段长度的增加,解旋酶的最高解旋幅度依次降低。在DNA底物的3’-尾链长度较短时,基本上只有一个慢解旋过程,随着3’-尾链长度的增加,快过程的解旋幅度显著增加,即RecQ5β对双链DNA底物的解旋依赖于3’-尾链长度。表明RecQ5β在对双链DNA进行解旋时具有协同性,这与以往E.coli RecQ的解旋特性截然不同,在SF2解旋酶超家族中是有趣的发现。9.RecQ5β解旋酶的N-末端467个氨基酸足够介导RecQ5β的解旋活性,多余的氨基酸序列会抑制其解旋活性,RecQ5β解旋酶自身存在一定的活性调节机制。N-末端467个氨基酸包含一个完整的解旋功能结构域,这为RecQ5功能域的划分提供了重要的理论依据。10.通过解离动力学分析,发现BLM持续解旋能力较低的原因在于,在ADP·Pi和ADP状态下BLM从DNA底物上解离的速率非常大,分别为3.9和4.8s-1,因此很容易从核酸链上解离下来,从而不能持续高效的进行解旋。