抗感染土壤源放线菌的分类鉴定

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放线菌因其产抗菌生物活性物质方面的优越性,而在新抗生素的发现方面一直备受关注,尤其是其中的链霉菌属。同时,随着各种放线菌的陆续分离研究和新抗生素的不断发现,使得从普通生境中筛选出新放线菌菌株,尤其是从中发现新抗生素的概率不断降低。由此,基于新生境或特殊生境的放线菌可能发现新抗生素的推断,众多学者在发现新抗生素的过程中,不断寻求从特殊生境中分离出新的放线菌,以期发现新的抗生素及其他生物活性物质。课题组前期从中国民间用于防治狗咬伤后伤口感染的土壤样品中分的61株放线菌,并对各菌株的发酵液进行抗MRSA活性测定,发现6株菌对MRSA指示菌株具有显著的拮抗活性。为此,该论文采用多相分类法对6株菌进行分类鉴定,为后续抗MRSA活性代谢产物的深入研究和新抗生素的发现奠定基础;并期望通过6株菌的分类鉴定,初步探讨该抗感染土壤中微生物群落的亲缘关系,为抗感染土壤在防止感染方面的深入研究打下基础。本研究采用多相分类法,对6株菌的形态学特征、培养特性、生理生化特征、细胞壁细胞膜化学分析和16S rRNA序列等进行研究和鉴定,其中:(1)生理生化特征的研究结果表明:6株菌Y1、Y2、Y7-Y10的最适温度为30-35℃;菌株Y1、Y2、Y7、Y8最适pH在pH6-8范围内,菌株Y9、Y10的最适pH范围则在pH4-6.5之间;盐度对于6株菌的生长影响较大,低于1%时长势良好,高于5%时开始出现不生长的情况;6株菌的发酵液对指示菌显示出不同程度的抗菌活性,尤其是对多重耐药菌MRSA均具有显著的拮抗活性。(2)菌株化学分析表明:6株菌株的细胞壁氨基酸含有LL-DAP、Gly。细胞壁糖含有Xyl。细胞膜磷酸类脂只含有PE,为磷酸类脂Ⅱ型。(3)16S rRNA基因序列分析:对Y1、Y2、Y7-10六株菌进行16S rRNA基因序列分析,并构建系统进化树,最终鉴定结果为六株菌株属于链霉菌属,与形态学特征、化学分析等分类鉴定方法结果一致。并且通过建立系统发育树,也了解到菌株Y1、Y2、Y8与Streptomyces eurocidicus、Streptomyces stramineus、Streptomyces netropsis聚成小群,亲缘关系较近;菌株Y7与Streptomyces puniceus聚成小群,亲缘关系较近,菌株Y9、Y10与Streptomyces cinnamonensis、Streptomyces cinnamonensis、Streptomyces virginiae、Streptomyces manipurensis聚成小群,亲缘关系较近。综合以上多相分类鉴定结果表明:6株放线菌均为链霉菌属,其源于同一特殊生境的土壤,分类鉴定结果表明6菌株之间的亲缘关系较近;同时,生理生化特征分析表明6菌株具有显著的抗多重耐药菌MRSA活性。
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