论文部分内容阅读
本研究以ADIPOQ,UCP1和FGF21基因为候选基因,应用PCR-SSCP技术,针对美利奴羊(Merino)、特克赛尔羊(Texel)、丘陵陶赛特羊(Dorset Down)、新西兰罗姆尼羊(New Zealand Romney)、萨福克羊(Suffolk)、考力代尔羊(Corriedale)、杜泊羊(Dorper)、派伦代羊(Perendale)和藏绵羊(Tibetan sheep)9个绵羊品种,探索了上述3个基因共16个区域的核苷酸序列。在对多态性较为丰富的基因区域(如ADIPOQ基因外显子1,UCP1基因启动子区和FGF21基因外显子3区),用来自不同公羊家系1200只左右新西兰罗姆尼羔羊,分析核苷酸变异及单体型对生长性状和胴体肌肉性状的影响,探讨候选基因遗传变异作为绵羊生长、脂肪和胴体性状分子标记的可能性。主要研究结果如下:1.ADIPOQ,UCP1和FGF21基因多态性(1)在ADIPOQ基因启动子区检测到4条变异序列(A1-D1)和7个SNPs位点;在外显子2区检测到4条变异序列(A2-D2)和6个SNPs位点;在外显子3-1区检测到3条变异序列(A3-C3)和3个SNPs位点;在外显子3-2区和3’UTR区均检测到2条变异序列(A4-B4和A5-B5),分别包含2个SNPs位点和1个SNPs位点。在所检测到的19个SNPs位点中,有2个位于编码区的变异且为非同义突变,分别为位于第2外显子的c.46 T/C突变导致p.Tyr16His氨基酸变异,位于第3外显子的c.515 A/G导致p.Lys172Arg氨基酸变异。(2)在UCP1基因启动子1区共检测到6条变异序列(A1-F1)和12个SNPs位点;在启动子2区共检测到3条变异序列(A2-C2)和2个SNPs位点;在内含子1-1区共检测到5条变异序列(A3-E3)和8个SNPs位点;在内含子1-2区没有检测到多态位点;在内含子5区共检测到3条变异序列(A5-C5)和6个SNPs位点;在外显子6区共检测到3条变异序列(A6-C6)和2个SNPs位点;在所检测到的30个SNPs位点中,有1个在编码区的变异为非同义突变,为位于第6外显子的c.910 G/A突变导致p.Ala304Thr氨基酸变异。(3)在FGF21基因启动子1-外显子1区检测到2条变异序列(A1-B1)和2个SNPs位点;在外显子1-外显子2区检测到4条变异序列(A2-D2)和6个SNPs位点;在外显子2区检测到2条变异序列(A3-B3)和7个SNPs位点;在内含子2区检测到3条变异序列(A4-C4),包含3个SNPs位点:在内含子2-3’UTR区检测到4条变异序列(A5-D5),包含4个SNPs位点。在所检测到的22个SNPs位点中,有2个在编码区的变异为非同义突变,分别为位于第1外显子的c.161 T/C突变导致p.Ala54Val氨基酸变异,位于第3外显子的c.554 C/T导致p.Pro185Leu氨基酸变异。2.ADIPOQ,UCP1和FGF21基因突变及单体型对新西兰罗姆尼绵羊生长性状的影响(1)等位基因分析结果表明,ADIPOQ基因启动子区等位基因只与断尾时体重关联(P<0.05),对其它生长性状无影响(P>0.05),且缺失等位基因A1的个体有较高的断尾重。第2内含子等位基因对所有生长性状无影响(P>0.05)。单体型分析表明,由启动子区和内含子2区构成的8种单体型中,单体型A1-A3与断奶前平均生长速度关联(P<0.05),缺失单体型A1-A3的群体有更高的生长速度。(2)等位基因分析结果表明,UCP1基因启动子区等位基因对所有生长性状无影响(P>0.05)。第5内含子等位基因与初生重关联(P<0.05),存在等位基因C5的群体初生重高于缺失群体。单体型分析结果表明,单体型与断奶前各生长性状无显著相关性(P>0.05)。(3)等位基因分析结果表明,FGF21基因外显子3区等位基因对生产性状无影响(P>0.05),但基因型对断奶前平均生长速度有显著影响(P<0.05),且存在基因型A5A5的群体较其它基因型有更快的生长速度。3.ADIPOQ,UCP1和FGF21基因突变及单体型对新西兰罗姆尼羊胴体肌肉性状的影响(1)ADIPOQ基因启动子区等位基因A1与热胴体重、后腿瘦肉量、腰部瘦肉量和总瘦肉量存在关联性(P<0.05),等位基因B1与后腿瘦肉量、后腿瘦肉比例和肩部瘦肉量存在关联性(P<0.05),其它胴体性状与等位基因无关联性;基因型与热胴体重、后腿瘦肉量、腰部瘦肉量和总瘦肉量有关联性(P<0.05)。第2内含子等位基因C3与GR值有关联性(P<0.05),其它胴体性状与等位基因无关联性(P>0.05);基因型与GR值有关联性(P<0.05)。单体型A1-A3与后腿瘦肉量、腰部瘦肉量和总瘦肉量有关联性(P<0.05),A1-C3与GR值和腰部瘦肉比例有关联性(P<0.05),B1-A3与后退瘦肉比例和肩部瘦肉比例有关联性(P<0.05)。双体型与热胴体重、后腿瘦肉量、腰部瘦肉量和总瘦肉量有关联性(P<0.05)。(2)UCP1基因启动子区等位基因B2与热胴体重关联(P<0.05),其它等位基因与胴体无关联性(P>0.05);基因型也只与热胴体重有关联性(P<0.05)。第5内含子区等位基因与基因型与各胴体肌肉性状均无关联性(P>0.05)。单体型A2-B5与热胴体重和腰部瘦肉量有关联性(P<0.05),单体型C2-C5与后腿瘦肉比例有关联性(P<0.05),对其它胴体肌肉性状无影响。(3)FGF21基因各区域变异位点之间存在很高的连锁关系,因此只对高度多态的内含子2-外显子3区与绵羊生长于胴体肌肉性状进行关联性分析,结果表明,等位基因均对各胴体肌肉性状无显著关联影响(0.05<P),只有等位基因A5对GR值有一定的影响趋势(0.05<P<0.2),各基因型均对胴体肌肉性状无影响(0.05<P)。综上所述,ADIPOQ基因、UCP1基因和FGF21基因均具有丰富的多态性,且ADIPOQ基因和UCP1基因的部分等位基因及单体型可作为绵羊生长及胴体肌肉性状的候选分子育种标记。