目的：介绍蛋白组学研究原理,描述针灸蛋白组化的研究现状,为针灸治病机理研究提供新思路。方法：计算机检索,数据库为重庆维普库(VIP)、中国知网(CNKI)、万方数据库(WANFANG)和外文医学期刊全文数据库(PubMed);检索时间设定为1989-2010；以‘’Western blot" OR"蛋白质组学”OR“双向凝胶电泳”AND“针刺”OR“灸”为关键词。结果：纳入针灸蛋白组化研究文献共14篇,其中动物实验研究13篇,临床试验1篇,病种以神经系统疾病为主,包括：脑梗塞、胃黏膜损伤、偏头痛、快速性心律失常、损伤脊髓、单纯性肥胖、胃溃疡。结论：1.目前开展的针灸蛋白组化研究以针刺为主,灸法研究较少；2.研究以动物实验为主；3.研究病种以神经系统疾病为主；4.研究由总体观察针灸引起的蛋白组化效应向细致观察单穴或者单条经络的蛋白组化效应发展,即研究向细致化、系统化方向发展；5.目前研究显示,针灸的双向调节、整体调节在蛋白组化效应上有所体现,即：针灸可使有益于健康的蛋白上调,同时也可使有损于健康的蛋白下调；针灸可引起体内多种蛋白的表达。针灸学是生命科学的分支学科之一,针灸效应是一种生命活动现象,生命活动是建立在蛋白质及其相互作用基础上的信息传导过程这一过程是基因表达、蛋白质功能表现、蛋白质-蛋白质相互作用的信息反应序列。因此从蛋白质组化入手,研究针灸效应的应答蛋白组,将是研究针灸疗效机制的最佳途径。