APP/PS1双转基因小鼠差异表达microRNA的筛选及初步验证

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目的:阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是引起痴呆的主要疾病之一,明确其分子机制对于AD的诊断与治疗有重要意义。micro RNA(miRNA)是一类基因表达的转录后调节因子。目前,已有研究表明mi cro RNA与Aβ沉积、tau蛋白过度磷酸化、氧化应激以及线粒体功能障碍等AD机制有关。但是,micro RNA在AD病理机制中的作用尚不明确。本研究通过检测AD模型APP/PS1双转基因小鼠海马组织中差异表达的m icro RNA及对其靶基因进行预测,并对靶基因进一步进行GO富集分析及KEGG信号通路分析。并探索有哪些micro RNA参与AD的发病机制,为AD的诊断与治疗提供新的靶点。方法:1.通过APP/PS1双转基因小鼠建立阿尔茨海默病模型。应用小鼠基因鉴定确定实现APP/PS1基因的双转,并通过Western blot及免疫荧光检测β淀粉样蛋白表达。2.利用miRNA测序(miRNA-seq),检测APP/PS1双转基因小鼠组与对照组之间差异表达的miRNA。3.应用miRDB、Target Scan数据库对显著差异表达的miRNA进行靶基因分析,并进一步应用GO、KEGG实现靶基因的功能与通路的富集分析。4.通过实时定量荧光聚合酶链式反应(Real-time reverse transcription-quantitative Polymerase Chain Reaction,RT-q PCR)对APP/PS1组和对照组海马组织中miR-133a-5p、miR-297a-5p的表达差异情况进行验证。结果:1.AD动物模型的建立:基因鉴定筛选APP/PS1双转基因小鼠。应用Western Blot和免疫荧光证明,与正常对照组相比,在APP/PS1双转基因小鼠组海马组织中Aβ1-42沉积。且对Western Blot结果进行量化分析,两组之间的差异有统计学意义(P<0.05)。2.micro RNA测序及差异表达miRNA的筛选:miRNA-seq共获得了1379个miRNAs,差异表达的miRNAs有598个。以︱FC︱>1.5且P<0.05为筛选条件,进一步筛选出的显著差异表达miRNAs有33个,其中,表达上调的miRNAs有15个,表达下调的miRNAs有18个。3.靶基因预测及功能性分析:对14个显著表达差异的miRNA进行靶基因预测,共获得722个靶基因,其中上调的有475个,下调的有247个。并进一步分别通过GO富集分析、KEGG信号通路分析靶基因参与的生物过程以及信号通路,所获得的靶基因主要集中在尼古丁成瘾、吗啡成瘾、谷氨酸能突触、癌症、脂代谢、钙信号、自噬等信号通路中。4.实时荧光定量PCR验证:应用RT-q PCR对miR-133a-5p及miR-297a-5p的表达进行验证,发现在APP/PS1小鼠中miR-133a-5p表达上调、miR-297a-5p表达下调。结论:1.通过miRNA-seq发现在APP/PS1双转基因小鼠中显著差异表达miRNAs有33个,其中,15个miRNA表达上调,18个miRNA表达下调。对这些miRNA进行靶基因分析,所获得的靶基因主要参与尼古丁成瘾、吗啡成瘾、谷氨酸能突触、癌症、脂代谢、钙信号、自噬等信号通路中。2.通过RT-qPCR对miR-133a-5p、miR-297a-5p进行验证符合预期结果,miR-133a-5p上调、miR-297a-5p下调可能参与AD的发病和发展机制,可能成为AD治疗的新靶点。
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