LncRNA-TCONS_00029175在小儿急性淋巴细胞白血病细胞自噬中的初步研究

来源 :广东医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:laohuob
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】  1. 利用基因表达谱检测在B-ALL与T-ALL表达差异的lncRNA。  2. 研究表达差异较明显的lncRNA-TCONS_00029175在急性淋巴系白血病细胞B-ALL与T-ALL中对自噬的影响。  3. 探讨lncRNA-TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL中影响自噬的潜在分子机制。  【方法】  1.对收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例B-ALL,11例T-ALL)及6例正常小儿进行lncRNA表达谱及基因表达谱检测。  2.在临床样品和细胞株中利用荧光定量PCR验证lncRNA在B-ALL和T-ALL中的表达是否与表达谱芯片结果相一致。  3. 采用信息学分析方法构建基因网络图,探讨可能与TCONS_00029175有相互联系的基因。  4.在ALL中的B系SUP-B15和T系的Jurkat中敲低TCONS_00029175,在电镜和western blot水平上检测其是否发生自噬。  5.采用western blot技术检测TCONS_00029175是否可能通过调控Beclin1相关自噬通路降低了B-ALL和T-ALL细胞的自噬水平。  【结果】  1. 对前期收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例 B-ALL, 11例T-ALL)及6例正常小儿临床骨髓样品进行了lncRNA的表达谱检测。芯片结果显示,lncRNA 的表达谱可有效区分 B-ALL 与 T-ALL,表明了两者的lncRNA表达谱不同。  2. 扩大临床样本量对收集到的另外共115例的验证组,包括64例B-ALL, 43例T-ALL和8例正常小儿的骨髓样品采用real-time RT-PCR技术进行了验证, 结果证实跟正常对照相比,TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL中表达趋势相反并有显著差异性。并且在两种B-ALL细胞株(SUP-B15和RS4;11)以及两种T-ALL细胞株(Jurkat和CCRF-CEM)进行检测,发现TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL细胞株中表达的差异趋势与临床样本一致。  3. 对前期收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例 B-ALL, 11例T-ALL)及6例正常小儿临床骨髓样品进行了基因芯片表达检测。通过基因网络图分析,发现TCONS_00029175与较多与自噬相关的基因相互联系,如CAMK4,SGPP1,FLT3,ELK3,AGRP,CD7,APOBEC2,RAB13,HMGCR, SOCS2,GCLC,CTGF,CD9等。  4.结合电镜图片和自噬标志蛋白LC3B的western blot结果显示,在B-ALL中表达升高的 TCONS_00029175 可以抑制 B-ALL 中细胞的自噬水平,而在T-ALL中表达降低的TCONS_00029175抑制了T-ALL细胞中的自噬水平。  5.敲低TCONS_00029175导致SUP-B15细胞Beclin1的表达升高但引起Jurkat细胞Beclin1的表达降低,表明在B-ALL中表达升高的TCONS_00029175可以抑制 Beclin1 的表达从而抑制自噬水平,而在 T-ALL 中表达降低的TCONS_00029175也是可以抑制Beclin1的表达进而抑制自噬水平。  6.核质分离实验表明,TCONS_00029175在细胞核和细胞质内均有分布,主要分布于核内。  【结论】  1. 芯片结果表明,ALL的不同亚型B-ALL与T-ALL有着各自独特的lncRNA表达谱和基因表达谱。  2. 针对TCONS_00029175在129例验证组临床样本以及细胞系的real-time RT-PCR检测结果表明,其表达与芯片结果一致。  3. B-ALL与T-ALL中表达相反的TCONS_00029175可能通过调控Beclin1参与的通路降低了B-ALL和T-ALL细胞的自噬水平而促进了B-ALL和T-ALL的发展。  4. 核质分离实验表明,TCONS_00029175在胞核和胞质均有分布,且主要分布于核内,表明该lncRNA可能在调控基因的转录水平发挥着更为重要的功能。
其他文献
高职院校通过校企合作、利用顶岗实习培养高质量的适合市场需要的学生,但在顶岗实习过程中的学生教育管理尚存在一定的问题,辅导员要分析工作对象和条件的变化,及时调整工作
期刊
分析了造成配网运行中的薄弱点的自然因素、社会因素、管理因素及配网自身因素,并针对具体的配网薄弱点,从技术、管理和法律法规不同方面,提出了相应的有效应对措施,以提高配
自主学习是个体终身学习和毕生发展的基础,是课程改革强调的一种学习方式,培养学生的自主学习能力已经成为世界范围内教育的重要目标.改变以教师为主的课堂模式早已成为课程
期刊
对国内外高校大学生性别间的学习差异现状进行研究,并针对高校女生学习成绩越来越好,男生成绩却不那么显著的现象,从女生学习观念强于男生的成因分析,并就加强女生成绩、改善
大学英语第二课堂是大学英语教学体系中的一个重要组成部分,它的价值为越来越多的学者所关注。因此,本文拟通过对我校近一年来开展的一系列大学英语第二课堂活动的组织、实施
中国智能机器人’98学术研讨会暨中国人工智能学会第三届智能机器人学术研讨会于1998年5月30日—6月2日在杭州召开.这是一次关于智能机器人领域的全国性学术大会,来自全国各
第一部分:AMPA受体在大鼠坐骨神经再生中作用有效性的实验研究;目的:观察α-氨基-3-羧基-5-甲基异噁唑-4-丙酸(AMPA)受体对大鼠坐骨神经损伤后神经再生的影响.结论:AMPA受体
前言 经皮冠状动脉介入治疗(PCI)目前已成为治疗冠心病的常规治疗手段,它包括经皮腔内冠状动脉成形术(PTCA)及冠状动脉内支架置入术。进行PTCA的同时置入支架已占总治疗的7
目的:Chiari畸形(Chiari malformation,CM)是一种以小脑扁桃体下疝入枕骨大孔的先天性神经管内畸形,脊髓空洞症(syringomyelia,SM)为Chiari畸形常见的伴发症,其发病机制目前尚存争议
目的:  探讨肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(A20)和肿瘤相关因子双肾上腺样激酶1(doublecortin-like kinase 1,DCLK1)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织中的表达情况