蝇蛹金小蜂地理居群COI和ITS基因序列系统进化分析及微卫星多态性位点筛选

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蝇蛹金小蜂(Pachycrepoideus vindemmiae)是家蝇蛹期常见寄生蜂种类,属于小蜂总科(Chalcidoidea)金小蜂科(Pteromalidae)。它广泛分布于全球不同地区,是多种蝇类害虫的优势寄生蜂种类,在果园和畜牧养殖业的生物防治中有重要作用。为了获得该物种遗传多样性信息及种群系统进化动态发展,我们利用线粒体COI基因、核基因ITS1和ITS2为标记,对中国12个不同地方蝇蛹金小蜂的遗传多样性进行了系统分析,并基于序列信息对该种群历史动态进行了初步探讨。我们发现来自儋州的蝇蛹金小蜂与大陆其他种群比较有差异。随后,我们采用磁珠富集法构建微卫星文库,筛选出多态性微卫星位点,利用这些位点对蝇蛹金小蜂种群遗传多样性进行初步分析。具体研究结果如下:  对中国12个地方的蝇蛹金小蜂样品的COI基因、ITS1和ITS2部分序列进行扩增测序。蝇蛹金小蜂线粒体 DNA COI基因序列可用于分析的长度为707bp,碱基T、C、A、G平均含量分别为41.9%、12.1%、32.4%和13.7%。ITS1和ITS2可用于序列分析的长度分别为994bp和331bp。ITS1基因序列碱基T、C、A、G平均含量分别为24.1%、22.3%、27.5%和26.0%, ITS2基因序列碱基T、C、A、G平均含量分别为23.9%、21.4%、29.9%和24.8%。结果表明,序列未见插入和缺失。对COI序列、ITS1序列及ITS2序列进行拼接处理和分析,使用MEGA5.0软件,建立MP树,发现来自儋州的蝇蛹金小蜂与大陆其他种群比较略有差异,可能地理区域隔离导致这种情况的产生。  利用生物素标记的(AC)12、(AG)12两种探针,筛选得到250个阳性克隆进行测序。根据测序结果设计得到120对引物。利用PCR方法检测设计得到的引物,结果表明12对引物能够特异性扩增。随后,利用TP-M13-SSR毛细管电泳对12对引物进行检测,最后筛选得到10对多态性位点引物。在10对多态性位点引物中,BL2, BL5, BL7经分析偏离哈温平衡。对筛选出来的10对多态性位点引物对30个蝇蛹金小蜂个体进行检测,单个位点的等位基因变化范围是3-7个,平均每个位点拥有5.50个等位基因。观察杂合度(Ho)变化范围是0.300-0.867,平均观察杂合度是(Ho)0.407;期望杂合度(He)变化范围是0.369-0.775,平均期望杂合度(He)为0.666。蝇蛹金小蜂的多态信息含量(PIC)为0.334-0.724,平均多态信息含量(Mean PIC)为0.607。因此可知,这些微卫星标记引物可以被有效的用于蝇蛹金小蜂种群的遗传谱系构建和种群的个体筛选。
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