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第一部分HBV负链冗余序列区碱基组成对复制的影响
目的:观察乙型肝炎病毒(HBV)负链冗余序列区(r)碱基组成对复制及第三次模板转换的影响。
方法:利用不依赖酶切和链接的分子克隆方法(RLIC)构建负链3r、5r单碱基突变或者双侧r区单碱基同时突变的HBV1.1倍体质粒,分别转染HEK293细胞,提取细胞内HBV复制中间体并用Southern Blot检测;各突变质粒分别与质粒PEGFP-N1共转染HEK293细胞,提取细胞总RNA,再用Northern Blot检测HBV RNA。
结果:与野生型相比,3r和至少部分5r单碱基突变型的细胞内HBV DNA总量及rcDNA的量没有明显改变;双侧r区T1821G突变体导致细胞内各种形态的HBV DNA均显著降低,而双侧r区nt1820、nt1822、nt1823碱基同时突变不显著影响HBV DNA的复制水平;双侧r区T1821G突变体的pgRNA量为野生型的43.9%,而两种单侧T1821G突变体pgRNA转录水平与野生型相当。
结论:负链3r和至少部分5r单个位置的碱基组成对HBV复制及第三次模板转换没有明显影响;双侧r区T1821G突变能显著降低HBVDNA复制水平,这种效应具有位置和碱基特异性;双侧r区T1821G突变降低HBV DNA复制的效应至少部分可由pgRNA转录水平降低来解释,而该种突变究竟通过何种机制导致pgRNA减少有待进一步研究。
第二部分HBV M蛋白N末端序列对S结构域包装功能影响的探索研究
目的:观察HBV中(M)蛋白N末端序列对S结构域包装功能的影响。
方法:利用不依赖酶切和链接的分子克隆方法(RLIC)构建M蛋白和S蛋白表达缺失的HBV1.1倍体质粒,利用酶切连接的方法构建表达M蛋白、S蛋白、N末端不同程度截短的M蛋白的质粒;将突变质粒和表达质粒共转染HepG2细胞,用Southern Blot检测培养上清中是否存在病毒复制中间体。
结果:成功构建了M蛋白和S蛋白表达缺失的HBV1.1倍体质粒,表达M蛋白、S蛋白、N末端不同程度截短的M蛋白的质粒;在不能表达M蛋白和S蛋白的HBV培养上清中检测到病毒复制中间体,与在反式提供S蛋白后培养上清的病毒复制中间体的检测量相当。
结论:核心颗粒可以不依赖外膜蛋白而释放出胞;我们需要建立分离完整病毒颗粒的免疫沉淀方法,来检测细胞培养上清中是否含有完成外膜包装的病毒颗粒。