在后基因组时代,蛋白质组学研究是生命科学研究的主要内容之一,随着研究的深入目前已经进入亚细胞蛋白质组学研究时代。亚细胞结构蛋白质提取是研究的必要步骤,但是传统的亚细胞结构蛋白提取技术存在着各种的缺陷,如:手工匀浆操作人为因素对实验的影响,基因组DNA的释放会使裂解物变得极为粘稠影响后续分离;常用表面活性剂裂解效率高但是可能会使蛋白变性丢失;分离亚细胞蛋白对实验设备要求高,样本需求量大等等。本研究拟开发一种基于离心柱的柱式蛋白提取新技术,开发柱式提取法及配套试剂,并开发了对应亚细胞结构蛋白分离提取试剂盒产品。在柱式提取法的基础上,结合表面带正电荷的SiO2纳米粒,能通过电荷力亲和提取细胞膜,实现膜蛋白高纯度的提取。（1）通过扫描电镜对加压烧结成形的离心柱滤芯多孔材料微孔和表面形貌进行表征;（2）进行总蛋白提取和膜蛋白提取,开发优化与柱式提取法配套的基础提取试剂;（3）在基础试剂上,以细胞和组织的膜蛋白,细胞核-胞浆蛋白,线粒体蛋白为目标,以市售试剂盒为对照组,优化基础试剂和提取方案,开发对应的亚细胞结构蛋白分离提取试剂盒;（4）以细胞膜为提取目标,基于正负电荷结合原理,制备了表面带正电荷的SiO2纳米粒,通过Zate电位仪及粒径分析,对其进行表征。结合柱式提取法后,对比市售试剂盒,验证其能否进行高纯度的提取膜蛋白。实验结果表明:通过离心惯性作用配合复杂孔道,离心柱能有效的裂解细胞,并除去基因组DNA。开发的几种亚细胞结构蛋白分离提取试剂盒,在提取的蛋白浓度及蛋白种类方面达到市售优秀进口试剂盒水平,超过了目前广泛使用的RIPA提取法以及相应的试剂盒。制备的表面带正电荷的SiO2纳米粒,能较长时间带有正电荷,并且粒径更小,结合柱式法后能高纯度的提取膜蛋白。与传统法对比,柱式提取法实验操作简单,提取时间短,可小样本提取,不需要超速离心机,提取效果优于市售试剂盒。在结合正电荷SiO2纳米粒后,能高纯度提取膜蛋白,对比抗体纳米磁珠,具有更低的成本,不需要专门的磁场分离设备,并且易于保存。柱式提取技术产品,将有效降低设备要求,简化操作步骤,提高提取效果和适应性,该技术有望开发成一种科研新工具,并商品化。