随着我国社会与经济的快速发展,科研经费支出也越来越多,特别是高校科研课题经费报销存在着较多的问题,加大了科研经费报销的难度。对高校科研课题经费报销问题进行研究,有利于揭示高校科研经费管理的本质与内在规律,这样可以进一步推动高校科研活动的完善,实现科研课题经费的规范化管理,提高经费使用的效率,有极大的理论价值和实践意义。当前我国已经开始逐渐关注高等院校的科学研究经费管理,有关经费报销的管理机制逐渐健全,高等院校的科研经费管理水准逐渐提升。而随着经费来源路径的增多与数目的增加,经费报销存在的难题也逐渐增加,变成高等院校财务管理机构需要重视的内容。所以,学校一定要强化对科研课题经费报销管理,探求完善路径。本论文梳理相关研究文献,界定本研究边界及相关概念的基础上,通过相关理论的分析,采用文献研究、比较分析及案例分析相结合的研究方法,对J高校科研课题经费管理制度问题进行了深入剖析,力图寻找问题源头。高校科研课题经费报销管理制度有着系统的框架,包括基于预算管理理论的经费管理、基于成本管理理论的经费管理、基于绩效评价理论的经费管理。本研究以J高校科研课题经费报销管理为对象,根据J高校科研课题经费管理制度原则与目标,分析了 J高校科研课题经费管理制度存在的问题,主要有经费报销预算不科学、科研课题经费支出不规范、科研课题管理与经费报销管理缺乏沟通、科研资产的管理不规范、课题结束未结账现象较为严重等。并对相关管理制度进行了科学设计,主要包括科研课题经费报销管理的组织结构、科研课题经费的预算管理、科研课题经费的合算、科研课题经费的监督评价等制度的详细设计。最后分析J高校科研课题经费管理制度重构与效应,通过实践效应的分析,进一步验证和明确了 J高校科研课题经费报销流程与管理制度的有效性,为推动学校进一步提高社会与经济效益,充分反映考虑该高校科研课题项目的运作状况,具有一定的理论依据与现实启发意义。