微生物介导的氮素矿化作用、硝化作用和反硝化作用等，在土壤氮素循环中起着重要作用。微生物群落作为基本功能单位决定着这些微生物过程的进程，因此，土壤微生物多样性研究是土壤氮素循环研究领域中一个至关重要的内容。作为重要的农业管理方式，施肥和灌溉对土壤微生物群落及其功能有着重要影响。本论文以山西运城“中澳粮食主产区水肥优化管理试验区”小麦-玉米轮作农田为试验地点，研究了传统和优化两种水肥管理方式下的土壤总矿化速率、总硝化速率、微生物量碳的变化，以及土壤细菌群落结构变化，并获得以下主要结果：　　 (1)不同水肥管理方式下共计四个处理：传统施氮肥区(A-UN)、传统不施氮肥区(A-NN)、优化施氮肥区(B-UN)和优化不施肥区(B-NN)。传统水肥管理区的灌溉方式为漫灌，冬小麦生长期土壤施氮肥量为85.0kgN/ha，玉米生长期施氮肥量210kgN/ha。优化水肥管理区的灌溉方式为喷灌，冬小麦生长期土壤施氮肥量为120kgN/ha，玉米生长期施氮肥量为120kgN/ha。土壤样品采集时间分别为3月份冬小麦土壤施肥前和施肥后、5月份冬小麦孕穗期、6月份冬小麦收获期、7月份玉米抽雄期和9月份玉米收获期。　　 (2)在冬小麦生长期，无机氮肥的施入明显改变了优化水肥管理区土壤细菌群落结构，但未发现对传统水肥管理区土壤细菌群落结构的明显影响。在玉米生长期，无机氮肥的施入对两种水肥管理区土壤细菌群落结构影响均较小。在所有处理中，细菌群落结构有着明显的季节变化性，不同季节之间细菌群落结构变化较大。　　 (3)优化施氮肥处理中(B-UN)存在着丰富的氨氧化细菌，该土壤中的氨氧化细菌属于Nitrosospira，且都归于Nitrosospira cluster3。优化施氮肥处理中(B-UN)也存在着氨氧化古菌，但氨氧化古菌的类群比较单一，存在着一个绝对优势类群，测序结果表明此氨氧化古菌属于泉古菌门。在两个不同时期(3月和5月)，氨氧化细菌的群落结构发生了较大变化，而氨氧化古菌的群落结构变化则很小。　　 (4)7月总矿化速率大于9月。氮肥的施入对矿化速率有激发效应，氮肥施入量越大，土壤氮素的总矿化速率越大。7月份土壤总矿化速率的大小顺序为传统施氮肥处理(A-UN)>优化施氮肥处理(B-UN)>优化不施肥处理(B-NN)，速率介于2.59mgN/Kg干土·d-1与12.6 mgN/Kg干土·d-1之间。9月份土壤总矿化速率介于1.84 mgN/Kg干土·d-1与2.28 mgN/Kg·d-1之间。土壤NH4+-N消耗速率与矿化速率极其显著正相关(R=0.914，p<0.001)，与总硝化速率显著正相关(R=0.496，p<0.05)，与NH4+-N浓度极其显著负相关(R=-0.803，p<0.001)。　　 (5)玉米田土壤总硝化速率一直处于非常低的水平，总硝化速率介于0.016mgN/Kg干土·d-1-0.22 mgN/Kg干土d-1之间。以7月优化施肥处理(B-UN)最高，为0.22 mgN/Kg干土d-1。土壤NO3--N消耗速率与土壤NO3--N浓度极其显著正相关(R=0.845，p<0.001)。土壤硝化潜势远大于土壤总硝化速率，土壤硝化潜势介于52.47 mgN/Kg干土·d-1-80.87 mgN/Kg干土·d-1之间。　　 (6)土壤微生物量碳有着季节变化性，7月份土壤微生物量碳大于9月份土壤微生物量碳。施无机氮肥使传统水肥区土壤微生物量碳迅速降低，降低幅度为28.7％，但对优化水肥区微生物量碳没有影响。无机氮肥的施入使土壤微生物量碳趋向降低，降低幅度为26％左右，至9月份，施肥区土壤微生物量碳(A-UN和B-UN)小于不施肥区(A-UN和B-NN)，且优化水肥管理微生物量碳大于传统水肥管理微生物量碳，这表明传统水肥管理不利于土壤微生物量碳的积累。