基于分子信息和数据挖掘的ⅢA期非小细胞肺癌术后个体化脑转移预测

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:coolwater_3
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:   1.探讨完整切除ⅢA期非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)术后高危脑转移的临床特征和分子指标。   2.运用数据挖掘技术中支持向量机(Support Vector Machine,SVM)的方法优化筛选预测ⅢA期NSCLC术后脑转移的临床、分子指标最佳组合模式,建立筛选ⅢA期NSCLC术后高危脑转移患者的个体化模型。   研究方法:   1.对193例完整切除术后的ⅢA期NSCLC患者进行生存分析,观察术后是否脑转移对生存的影响。   2.分析193例完整切除术后的ⅢA期NSCLC患者的临床资料,找出ⅢA期NSCLC术后高危脑转移临床因素。   3.利用组织芯片技术和免疫组化方法检测193例完整切除术后ⅢA期NSCLC患者肿瘤组织中31种分子标记物的表达情况,用受试者工作特征曲线(ROC曲线)选择各个分子指标较佳的免疫组化评分界限值,并利用传统的统计学方法分析这些分子标记物的表达与ⅢA期NSCLC患者脑转移的关系。   4.在193例ⅢA期NSCLC患者中,以130例作为训练集,运用数据挖掘技术中支持向量机的方法优化筛选预测ⅢA期NSCLC术后脑转移的临床、分子指标最佳组合模式,建立筛选术后高危脑转移患者的模型。用此模型对与训练集不重复的63例验证集单个病例的脑转移情况进行前瞻性个体化预测,比较预测结果与实际脑转移情况的一致性。   结果:   1.全组患者的中位生存期为829天,1年,2年,3年,4年和5年的累计生存率分别为80.3%、54.8%、37.6%、29.7%和21.9%。单因素和COX多因素回归分析发现术前血清CEA水平、术前血清LDH水平、术后是否行辅助化疗、术后是否行辅助放疗、终身是否脑转移是影响预后的独立因素。   2.全组患者术后脑转移的发生率34.7%(67/193),首发脑转移率24.4%(47/193),术后1、2、3年脑转移发生率分别为15.0%、31.5%、40.1%。单因素和COX多因素回归分析发现对脑转移有统计学意义的因素为:术前血清学CEA水平,是否鳞癌。   3.单因素生存分析发现分子标记物中Bax、β-catenin、CD44v6、CEA、CerbB-2、CK-HW、c-Myc、COX-2、Ki-67、P16、p63、PCNA、TGF-β、TIMP-1、S100与脑转移相关(p<0.05),进一步用Cox比例风险模型进行多因素分析,发现p63、TGF-β、TIMP-1三个分子指标是影响脑转移的独立因素。   4.利用数据挖掘中支持向量机的方法,对130例训练集患者的包括8个临床特征和31个分子标记物表达情况的共39个特征和脑转移的关系进行分析,筛选出术后化疗疗程数和Bax、cerb-B2、c-Myc、COX-2、EMA、FAS、Ki-67、MMP-2、NM23-H1、P27kip1、PTEN、TGF-β、TIMP-1、TIMP-2共15个指标,组合构建出预测ⅢA期NSCLC患者术后脑转移的模型SVM-ⅢA-BM,对130例训练集患者的脑转移预测正确率达到100%。   5.利用模型SVM-ⅢA-BM,对验证集63例ⅢA期NSCLC患者进行术后3年的个体化脑转移预测,脑转移高风险组1、2、3年脑转移率分别是41.8%、68.9%和84.5%,脑转移低风险组l、2、3年脑转移率分别是13.2%、16.8%和21.9%。两组比较有显著性差异(p=0.0000046),预测的敏感度为61.9%,特异度为88.1%,阳性预测值为72.2%,阴性预测值为82.2%,总的预测正确率为79.4%。   结论:   1.是否出现脑转移是影响ⅢA期非小细胞肺癌患者术后生存的重要因素,建立筛选术后高危脑转移患者的个体化模型具有很大的临床价值。   2.以临床、分子信息和数据挖掘为基础建立的脑转移预测模型SVM-ⅢA-BM,可以较准确地预测ⅢA期非小细胞肺癌术后高危脑转移,可作为ⅢA期非小细胞肺癌术后PCI临床研究筛选脑转移高危患者的依据。
其他文献
目的: 观察不同年龄阶段先天性麻痹性斜视与正常人眼外肌形态结构(显微、超微结构)的异同,探讨先天性麻痹性斜视的发病机制与手术时机。 方法: 收集先天性麻痹性斜视患者
本研究调研了美国、英国为代表的国家高校面试现状,从招生的面试方式、问题设计等方面进行系统性、深入性调查研究,结合我国特别是天津大学新近实施的博士招生“申请-审核”
摘要:随着我国经济发展进入新常态,对高等学校服务经济社会发展能力提出新的要求,高校逐步实现向应用技术类型高校转型,因此,《通信电子线路》课程改革的主要思路是理论教学服务于工程应用。一方面,采用“分层教学”和“任务驱动”的教学方法,应用启发式、研讨式的教学形式,让学生“翻转课堂”,将学习从课堂内拓展到课堂外。另一方面,将EDA技术引入到实践教学中来,采用课题教学模式,提高学生的系统设计能力及综合应用
随着我国人口老龄化的加重,中老年人群的比例逐渐升高,这部分人的生活质量和健康问题开始受到越来越多人的关注。中老年男性普遍存在不同程度的雄激素缺乏,并由此带来一系列
随着近几年教育事业的飞速发展,素质教育的口号喊的越来越响,可以说,素质教育已经深入人心,自从事美术教学几年来,经过理论上的不断学习和美术教学上的实践,本人认为美术教学
对于新建应用型本科院校而言,课程教学改革势在必行,新的教学模式的引进与使用可以给应用型本科教学注入新的活力,有助于提升课程的教学效率和课堂内容的吸收率.
根据已有实物的测量数据进行模型重建 ,在机械产品逆向建模、计算机视觉、基于二维轮廓数据的生物外形重建等领域中具有重要应用价值。随着坐标测量设备的发展 ,获取包含被测
随着经济建设和社会的迅速发展,消防工作面临着许多新情况、新问题.面对当前我国消防安全的战略环境,必须从理清发展思路,建立与市场经济体制相适应的消防管理机制,利用经济
目的:  血液从流动的液体状态变成不能流动的胶冻凝块的过程,即为血液凝固(blood coagulation)。这是由凝血因子参与的一系列蛋白质有限水解的过程。机体凝血系统包括凝血和抗
背景与目的:胶质瘤是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤,容易复发,死亡率高,难以治愈。手术、放疗、化疗作为其常规的治疗手段,一直没有突破性的进展。免疫治疗作为一种新的方法,已经