拟南芥中重叠基因的DNA甲基化修饰分析

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目前,除了DNA序列编码的信息,表观遗传对基因表达的影响越来越受到人们的重视。植物的表观遗传学研究也是当今研究的一个热点。由于表观遗传学在植物中的研究尚处于起步阶段,其测序得到的信息也仅限于几种模式生物,我们对植物中的模式生物-拟南芥重叠基因上的DNA甲基化信息进行了全面的分析,另外,我们还进行了拟南芥重叠基因的分析,对其试图找出DNA甲基化在调控基因表达上存在的一般规律。重叠基因的分析结果表明,拟南芥中的重叠基因与一般基因在长度上差异不大,也没有在整个染色体上的偏好性,但从基因注释的结果看,影响发育和基因印记的基因似乎在重叠基因里出现的概率较高,这表明,很多重叠基因是受其反义转录子的调控,而它们更容易被调控的特点,也恰恰说明在拟南芥遗传和发育过程中,很多基因受到了调控,很可能是小分子RNA的调控。重叠基因的DNA甲基化分析表明,甲基化主要富集在重叠基因的启动子区域,这与非重叠基因的观察结果一致。但是在重叠基因中甲基化水平更高。编码区序列也有DNA甲基化的出现,但甲基化程度比非重叠基因还要低。这似乎与以往的反义转录本研究相矛盾。相关机制还有待进一步探究。
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