我国中小高科技企业主要集中在新三板的融资平台上，伴随资本市场的多样化、多层次化发展，大量的企业选择挂牌新三板市场，随之而来的是新三板市场规模日益壮大，但是其融资效率不太明朗。为了规范市场行为，维护金融市场的稳定、有序发展，培植优质企业，引领市场投资，2016年，分层制度正式面世。为了提高整个新三板上市企业的质量，强化企业融资水平，激励企业向创新层看齐，监管层推出了分层制度，以期为创新层企业发展提供更有力的政策支持。近年来，学术界和实务界对分层制度的实施及其效果存在争议。因此，有必要就分层制度的实施对创新层企业的影响进行实证检验，为这一制度的完善提供客观的经验证据。
　　基于此，本论文以2016年监管层推出分层制改革为政策实验，收集了已在新三板市场挂牌(含已退市)的13285家企业数据，以2016年至2018年期间六个半年度的数据为样本，采用PSM—DID方法，从股票流动性、公司治理和企业绩效三个方面，实证检验了新三板分层制改革对创新层企业的影响。研究结果显示，首先，分层制度的实施明显改善了股票的流动性，创新层挂牌公司的股票交易相对活跃，经营能力都得到改善。其次，公司治理方面有改善迹象。虽然掏空程度未显著改善，但是进入创新层企业的违规有所减少，控股股东持股累计质押比例下降。最后，净资产收益率、营收增长率以及净利润增长率指标均未通过显著性检验，总体而言，分层对于创新层企业绩效的改善并不显著。这表明，对于创新层企业而言，分层制实施的效果是有限的，新三板市场和分层制度的进一步的深化改革是必要的。完善新三板市场的功能需要从以下几个方面来进行改革：第一、加强新三板市场的监管；第二、加强对创新层企业的管理；第三、企业自身提高自律水平；第四、推动转板机制，提高多层次资本市场高效联结。
　　为此，本文在上述方面做出了一些有益的探索，试图为政策的细化提供一些参考。