苎麻花发育相关AP2/ERF类基因的初步研究

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苎麻是多年生的植物,目前苎麻的育种目标,主要集中在产量,纤维品质,加工品质,抗逆性,饲用品质等方面,而开花会很大程度上,影响8月份以后生长苎麻的产量与品质。根据现有的生长周期,苎麻的开花,不利于三麻时期的营养生长,三麻期大量的开花结实,会导致苎麻的纤维品质和产量明显下降。本研究的目的是想通过对不同品种苎麻在不同时期不同部位的转录因子的表达,找到含AP2/ERF结构域与开花相关的转录因子,克隆出开花调控相关的基因,为后续苎麻开花调控研究奠定基础。本文的主要研究结果如下:(1)本文通过实验室前期的转录组数据,找到可信度比较高的七个转录因子,同时利用ExPASy,NCBI,Smart等生物信息学的网站进行核苷酸序列分析,氨基酸翻译以及氨基酸序列保守结构域搜索,对转录因子6896,18197,17478,15426N,15247n,9156,16687共七个进行分析,经过分析发现18197,17478,15247,6896,9156都含有AP2结构域,同时选取的七个转录因子,亲缘关系较远,具有一定的代表性,为后续研究提供理论方向。(2)本研究以3个苎麻品种为材料,采用actin作为内参基因,利用2个苎麻基因进行实时定量PCR体系的建立。结果表明采用试剂盒法提取的RNA可以满足RT-qPCR技术的要求,扩增曲线和熔解曲线都符合实验要求,actin基因可以作为内参进行苎麻相对定量分析研究。相对定量分析表明,本研究建立的RT-qPCR方法可以应用于基因表达水平的研究。(3)通过使用荧光定量PCR技术对苎麻黑皮蔸MS5,黑皮蔸MS9,大叶绿MS1,黄小叶,弯子苎麻,圆青5号,泸县青皮,梁平青麻,1313,1394共10个品种的非开花时期的7个可能基因的研究,发现在大部分苎麻品种中,转录因子9156,6896,17478,15426N,15247n和16687都有较明显的表达,其中9156,6896,17478含有AP2结构域。从部位来看,苎麻08品种雄花中9156,15247n,15426N,17478和09号品种的雌花部位的9156基因,表达量都较高,其中特别是9156非常显著,而苎麻08号是雌雄同株(GBN08),苎麻09号是全雌株(GBN09),都是从不育系的后代中选择而来,9156的高表达从某个方面证实可能与开花相关。(4)通过基因克隆技术,克隆出苎麻9156基因的CDS序列,其全长编码区为1302 bp,可以编码433个氨基酸,后续通过生物信息学分析,得出9156蛋白的分子质量为47.05359 Kdu,蛋白质的分子质量较小,有利于后续的原核表达或模式植物研究,此蛋白的理论PI(等电点)为9.04,属于碱性蛋白质。
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