【摘 要】
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研究背景:随着呼吸道感染性病原谱日趋多样化及复杂化,重症肺炎发病率呈上升趋势,死亡率及致残率居高不下,早期精准病原学诊断有利于靶向抗感染治疗,显著改善疾病预后,成为了目前研究的热点及重点。研究目的:通过比较支气管肺泡灌洗液宏基因组测序与常规病原学检测在成人重症肺炎诊治中的应用情况,明确支气管肺泡灌洗液mNGS较常规检测在重症肺炎患者中是否具有显著优势并能提升重症肺炎诊疗水平。研究方法:前瞻性分析我
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研究背景:随着呼吸道感染性病原谱日趋多样化及复杂化,重症肺炎发病率呈上升趋势,死亡率及致残率居高不下,早期精准病原学诊断有利于靶向抗感染治疗,显著改善疾病预后,成为了目前研究的热点及重点。研究目的:通过比较支气管肺泡灌洗液宏基因组测序与常规病原学检测在成人重症肺炎诊治中的应用情况,明确支气管肺泡灌洗液mNGS较常规检测在重症肺炎患者中是否具有显著优势并能提升重症肺炎诊疗水平。研究方法:前瞻性分析我院RICU 2019年8月至2021年10月收治的155例重症肺炎患者临床资料,根据患方是否同意行mNGS检查分为NGS组85例、对照组70例;两组患者均完善常规病原学检测,NGS组完善支气管肺泡灌洗液mNGS并根据测序结果调整抗感染治疗策略,对照组根据常规病原学结果调整治疗。分析两组患者基本信息、常规及mNGS病原学结果、初始及根据病原学调整治疗1周后APACHEⅡ评分和SOFA评分、器官功能支持情况（血管活性药物、有创机械通气以及CRRT使用率及时间）、抗感染调整情况、出院及28天和90天结局。研究结果:（1）两组患者性别、年龄、基础疾病构成及治疗前APACHEⅡ评分和SOFA评分均无显著性统计学差异。NGS组患者出院死亡率（23.53%vs 41.43%,P=0.02）、28天全因死亡率（28.24%vs 46.27%,P=0.02）及90天全因死亡率（29.41%vs 50.75%,P＜0.01）均显著低于对照组。（2）病原学检出情况:NGS组85例患者均行支气管肺泡灌洗液mNGS及常规病原学检测,mNGS阳性77例,8例阴性,常规病原学检测阳性49例,阴性36例,两种方法均阴性3例。mNGS阳性率显著高于常规病原学检测（90.59%vs 57.65%,P＜0.01）。（3）病原体构成情况:mNGS从85例患者中共检出病原体126例,常规病原学检测出65例,病原体分布为革兰氏阳性菌（20.63%vs6.15%）、革兰氏阴性菌（26.98%vs35.38%）、真菌（27.78%vs 24.62%）、病毒（11.90%vs 21.54%）、非典型病原体（5.56%vs 4.62%）、分枝杆菌（7.14%vs 7.69%）,mNGS较常规病原学检出更多肺炎链球菌、耶氏肺孢子菌、曲霉菌及鹦鹉热衣原体。mNGS诊断单纯感染与混合感染比例分别为61.18%、29.41%;常规检测分别为50.59%和7.06%,mNGS识别混合感染效能显著优于常规检测性（P＜0.05）。（4）病原学匹配情况:mNGS检测与常规检测完全相符率为28.24%（24/85）,部分相符率为11.76%（10/85）,完全不相符率为60.00%（51/85）。（5）抗感染治疗策略调整情况:NGS组52例患者根据mNGS结果调整了抗感染策略,33例无调整。其中21例常规检测阴性的患者根据mNGS结果调整治疗,18例好转,3例死亡。对照组30例患者根据常规检测调整了抗感染方案,40例无调整。mNGS有效指导率显著高于常规病原学检测（76.47%vs 58.57%,P=0.02）。（6）调整抗感染策略后1周NGS组患者APACHEⅡ评分（10 vs 17.5,P＜0.01）及SOFA评分（2 vs 5,P＜0.01）均显著低于对照组。NGS组ICU平均住院时间（6 vs 9天,P=0.02）、有创机械通气使用率（57.6%vs 82.9%,P＜0.01）及时间（P＜0.01）、血管活性药物使用率（32.9%vs 62.9%,P＜0.01）及时间（P＜0.01）均显著低于对照组;两组患者总住院时间（16 vs 16.5天,P=0.64）、总费用（4.89 vs 6.18万元,P=0.17）以及CRRT使用率（10.71%vs 20.00%,P=0.11）和时间（P=0.10）未见显著性统计学差异。研究结论:（1）支气管肺泡灌洗液mNGS较常规病原学检测阳性率及敏感性更高;尤其是在鹦鹉热衣原体、嗜肺军团菌、耶氏肺孢子菌、非结核分枝杆菌等常规病原学难以鉴定的病原体方面具有显著的优势,并有利于混合感染的识别。（2）支气管肺泡灌洗液mNGS有利于早期识别负责任病原体并指导靶向抗感染治疗,减少不必要的广谱抗菌药物使用,促进抗菌药物临床使用的合理管理。（3）支气管肺泡灌洗液mNGS指导治疗有利于降低重症肺炎患者器官功能衰竭发生率、减少ICU住院时间、降低死亡率,提升重症肺炎患者生存率,显著改善预后。
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