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在变分同化方法中，背景误差协方差矩阵对保证变分问题解的唯一性及分析的平滑性，反映不同变量之间的关系有着非常重要的作用。构造合理的背景误差协方差矩阵对于同化系统至关重要，甚至会决定同化分析的好坏。 目前我国的变分同化研究和国外比起步较晚，在背景误差协方差统计结构研究方面尚没有取得可以实际应用的成果，背景误差协方差统计结构研究成为当前数值预报业务与研究工作的一个亟待解决的问题。本文主要研究背景误差协方差结构的统计特征及其对三维变分同化系统的影响。 本文主要利用观测余差方法用T213模式的12小时、24小时预报资料和无线电探空观测资料统计出背景误差协方差样本，对单层的背景误差协方差样本进行高斯相关函数拟合，得到水平特征尺度与背景误差方差、观测误差方差：对于各层间的背景误差协方差结构进行分析时，分别用直接方法和厚度方法，得到各层间的背景误差协方差近似函数；在垂直方向用二阶自回归相关函数和垂直距离变换方法研究垂直背景误差的结构；最终获得水平和垂直可以分离的三维背景误差协方差空间分布模型。对于不同的相关函数模型对背景误差协方差的拟合也做了相关分析对比。 利用以上估计的背景误差和水平特征尺度，本文替换了GRAPES三维变分同化系统中原背景误差和水平特征尺度方案，并用GRAPES系统进行了台风同化预报试验。通过比较发现，同时改进GRAPES中水平特征尺度和背景误差后，改善了涡旋分析系统的风压平衡，提高了分析的质量。另外，对台风的强度和路径于预报也有一定的改善。