随着计算机技术的迅速发展，医院信息系统(HIS)己经成为医院不可或缺的一种快速、高效、准确的信息管理工具。随着HIS的发展，数据量越来越大，如何有效的利用这些数据已成为医院信息化建设中的一个问题。医院的领导希望通过数据分析，更好地进行管理决策。而临床也需要从海量的数据中找到一些潜在的疾病诊断规律，这正是数据仓库和数据挖掘研究处理的内容。 论文对数据仓库的概念、体系结构、开发设计的方法，以及数据仓库技术在HIS中应用的国内外现状进行介绍。同时对医院信息系统进行系统分析，对数据仓库技术在医院信息系统中的的应用进行研究。通过调研，在基本明确了需求之后，并结合医院信息系统的特点，建设基于数据仓库技术的医院息系统。本文阐述了本系统的分析、设计和实现的过程。 本文从医院信息管理的角度和决策支持的角度出发，根据决策者的需求，设计了多个不同的分析主题，包括病人信息管理、疾病治疗情况、药房药库管理和财务管理等，设计不同维度的数据表，来存储原始数据和用于决策分析的数据，并在系统中设计不同的模块，对数据进行管理。将历史数据导入到新的医院信息管理系统的数据仓库中，对医院数据进行分析和挖掘，如应用贝叶斯理论对阑尾病患者进行诊断，应用关联算法寻找肥胖病人的发病原因。