煤工尘肺候选基因单核苷酸多态性的关联分析研究

来源 :华北理工大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:shz0414
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目的近期的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)和候选基因关联分析发现多个基因与肺纤维化相关,包括桥粒斑蛋白基因(DSP)、家族序列相似性13A基因(FAM13A)、二肽基肽酶9基因(DPP9)、端粒酶逆转录酶基因(TERT)、端粒酶RNA基因(TERC)、核组装因子1基因(NAF1)和细胞色素b245α基因(CYBA)。本研究旨在探讨上述7个候选基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)与煤工尘肺(Coal workers,pneumoco niosis,CWP)的相关性,从而为CWP高危人群的早期筛查及遗传学机制研究提供理论依据。方法本研究采用病例-对照的研究方法,研究对象包括652例CWP患者和648例接尘对照者。通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(Matrix-assisted las er desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS),对16个SNP位点进行分型。应用PLink1.07软件分析各SNP位点基因型和等位基因频率分布差异,同时在相加模型、显性模型和隐性模型下分析各SNP位点与CWP的相关性。利用SHEsis软件进行连锁不平衡及单体型频率分析。采用SPSS17.0统计软件对相关数据处理分析。以P<0.05为差异具有统计学意义。结果1卡方分析结果显示,TERT基因rs2736100位点、NAF1基因rs4691896和rs3822304位点及CYBA基因rs7195830位点的基因型及等位基因频率在CWP组与接尘对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。CWP组TERT基因rs2736100位点C等位基因频率低于接尘对照组(OR=0.840,95%CI=0.717-0.984,P=0.031)。CWP组NAF1基因rs4691896位点T等位基因和rs3822304位点G等位基因频率均显著高于接尘对照组(OR=1.891,95%CI=1.536-2.330,P<0.001;OR=1.9622,95%CI=1.167-3.300,P=0.010)。CWP组CYBA基因rs7195830位点A等位基因频率显著高于接尘对照组(OR=1.550,95%CI=1.289-1.863,P<0.001)。DSP基因rs2076295、CYBA基因(rs13306296、rs4673、rs9932581和rs16966671)、TERC基因(rs10936599和rs12696304)、NAF1基因(rs7675998、rs12331717和rs936562)、DPP9基因rs12610495和FAM13A基因rs2609255位点的基因型和等位基因频率,CWP组与接尘对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。2遗传模型结果显示,TERT基因rs2736100和NAF1基因rs3822304位点在相加模型下与CWP有关(OR=0.844,95%CI=0.722-0.987,P=0.034;OR=1.959,95%CI=1.164-3.295,P=0.011)。NAF1基因rs4691896位点在相加模型和显性模型下均与CWP有关(OR=1.961,95%CI=1.579-2.436,P<0.001;OR=1.671,95%CI=1.142-2.442,P=0.008)。同样,CYBA基因rs7195830位点在相加模型及显性模型下均与CWP有关(OR=1.621,95%CI=1.334-1.970,P<0.001;OR=1.711,95%CI=1.197,P=0.003)。DSP基因rs2076295、CYBA基因(rs13306296、rs4673、rs9932581和rs16966671)、TERC基因(rs10936599和rs12696304)、NAF1基因(rs7675998、rs12331717和rs936562)、DPP9基因rs12610495和FAM13A基因rs2609255位点在三种遗传模型下均与CWP无关(P>0.05)。3单体型结果显示,NAF1基因rs7675998、rs4691896和rs936562构成的ACA、ATA、GCT和GTA单体型在CWP组中的频率分别为0.2%、17.5%、77.5%和4.3%,在接尘对照中相应的频率为5.7%、10.3%、78.6%和2.5%,两组之间单体型ACA、ATA和GTA频率差异有统计学意义(P<0.05),两组之间单体型GCT频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论1 TERT基因rs2736100、NAF1基因(rs4691896和rs3822304)及CYBA基因rs7195830位点与CWP相关,TERT基因、NAF1基因和CYBA基因可能是CWP的易感基因。2 NAF1基因rs7675998、rs4691896和rs936562构成的ACA、ATA和GTA单体型与CWP有关。
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