水上交通安全管理是海上交通工程学中的一项重要内容，是指为防止船舶和货物的损害以及防止海上污染而对指定水域内船舶行为的总体和相关水域环境所实施的管理。其目的是维持良好的水上交通秩序，以确保船舶流能够迅速、畅通和安全的运行，防止和减少船舶交通事故以及保护水域环境免遭船舶污染。本文针对厦门港水域的水上交通安全管理进行研究。 首先对厦门港及其附近水域的海上交通事故进行统计和分析，并且采用灰色理论分析方法将港口的不同区域与总体海事事故之间的关联度进行比较，其目的是希望找出影响水上交通安全的重点事故、水域和时间等要素。其次，通过认真研究厦门港口的历史统计数据和发展规划，采用三次指数平滑法对厦门港的吞吐量和到港船舶数量做短期的预测；再通过实态观察结果分析渔船和港内小型客船的数量和活动规律；得出港口的发展给水上交通安全管理系统提出的几个突出问题。在以上分析和研究的基础上，为厦门港水上船舶交通管理系统的工作思路提出自己的看法，并认为该系统下一步的工作重点应该是：交通组织功能的落实、VTS雷达盲区的逐步消除、重点监管对象的确立、通航条件的改善、事故处理预案的建立和小型客船管理力度的加强等等。