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聚羟基脂肪酸酯(Polyhydroxyalkanoates,简称PHA)主要是由(R)型-3羟基脂肪酸聚合而成,并在细菌体内累积的一类高分子化合物。相比传统的石化塑料,PHA在材料学性质上有着许多相似之处,但其具有可再生、可完全降解等特性,被认为是一种“可持续发展塑料”。随着对PHA的深入了解,发现有一类侧链含有苯环的PHA,称之为聚羟基苯基脂肪酸脂(Polyhydroxyphenylalkanoate,简称PHphA)。由于其具有良好的延展性和可塑性,在材料学性质方面与石化塑料更为接近,而且在医药方面(如作为可控药物缓释载体)有着更为突出的应用价值,而受到了关注。目前,由苯基脂肪酸的降解能够流向PHphA合成,但这条通路在分子水平上并不清晰。而且只有极少数细菌如Pseudomonas putidaU,P.putida BM01和P.Oleovorans能够合成PHphA,更加限制了PHphA的合成。基于本实验室曾对芳香化合物降解的模式菌株Cupriavidus pinatubonensis JMP134与PHA合成进行过研究,且JMP134菌株能够单独利用6-苯基己酸进行生长,所以决定以6-苯基己酸的代谢途径为契机,在JMP134菌株中进行由6-苯基己酸流向PHphA合成的初步探究。 当以6-苯基己酸为唯一碳源情况下,JMP134菌株可以产生聚羟基丁酸酯(polyhydroxybutyrate,简称PHB),并依据文献报道,推测6-苯基己酸先是通过β氧化途径降解为苯乙酰辅酶A,然后再通过苯乙酰辅酶A的开环途径进而被逐步降解的。通过对推测途径中的两套paa基因簇(paaA1B1C1D1E1和paaA2B2C2D2E2)进行转录水平的分析,发现这两套paa基因簇可能参与了6-苯基己酸的降解。 为了进一步证实paaA1B1C1D1E1和paaA2B2C2D2E2这两套paa基因簇确实参与了6-苯基己酸的降解,采用经典的遗传学方法,分别对paaA1B1C1D1E1和paaA2B2C2D2E2这两套基因簇的关键基因paaA1和paaA2进行了敲除和回补实验。发现paaA1B1C1D1E1和paaA2B2C2D2E2这两套基因簇确实参与了6-苯基己酸的降解,其中paaA1B1C1D1E1这套基因簇在6-苯基己酸的降解途径中发挥着主导性的作用,paaA2B2C2D2E2这套基因簇在6-苯基己酸的降解途径中发挥着辅助性的作用。随后,分析了当以6-苯基己酸为唯一碳源情况下,JMP134ΔpaaA1和JMP134ΔpaaA2突变株中PHB的合成量,发现JMP134ΔpaaA1中PHB的合成量明显减少,说明6-苯基己酸的代谢途径确实受到了干扰,可能有中间产物的积累。 由于JMP134菌株中没有合适的酶如(R)-型特异性的烯酯酰水合酶(PhaJ)和具有广泛底物范围的PHA合成酶(PhaC)等用于PHphA的合成,所以需要额外引入PhaJ和PhaC。文献指出,来自绿脓假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的4个R型特异性的烯酯酰水合酶(PhaJ1pa-PhaJ4pa)可以做为PHA合成途径中的有效工具酶,于是将这4个R型特异性的烯酯酰水合酶基因(phaJ1pa-phaJ4pa)分别与具有广泛宿主范围的表达载体pRK415连接,然后分别导入到野生菌株中,利用GC-MS检测、筛选,发现PhaJ1pa和PhaJ4pa对于JMP134菌株较为合适。 目前对于适合JMP134菌株用于PHphA合成的PHA合成酶(PhaC)还在寻找和试验阶段。虽然在JMP134菌株中,由6-苯基己酸流向PHphA的合成途径还未完全构建成功,但在JMP134菌株中已经搭建了一个平台,其可用于筛选适合PHphA合成的(R)-型特异性的烯酯酰水合酶(PhaJ)和具有广泛底物范围的PHA合成酶(PhaC)。本研究从分子水平上对苯基脂肪酸流向PHphA的合成途径进行了初步剖析,也为其它能够利用苯基脂肪酸的菌株合成PHphA提供一定的理论指导。