随着经济全球化的发展，医药商业企业在新的经济格局中将面临严峻挑战：首先，加入WTO以后，我国已逐步开放外资药品分销服务领域，这必将加剧国内药品经营市场的竞争；其次，药品是一类特殊的商品，国家规定医药经营企业必须执行《药品质量管理规范》(简称GSP，“Good Supply Practice”)，虽然目前我国有许多企业通过了GSP认证，但药品在销售过程中仍然采用手工纪录与操作，这使得医药企业之间的信息传递严重滞后，一旦出现药品的质量问题后就不容易追查；第三，信息技术的飞速发展，传统的管理手段已不能适应快速发展的企业管理的需求。本论文首先分析了医药商业企业信息化现状及存在的问题，然后阐述了ERP的理念、ERP的发展、ERP系统的主要功能以及我国GSP管理规范的基本要求，并运用层次分析法(AHP)建立了在GSP规范下的药品供应商的评价模型，接着分析了医药商业企业的主要业务流程，如采购业务、销售业务、仓存业务、质量管理等，并结合现代信息技术、ERP的理念和GSP管理规范的要求，对医药商业企业传统的业务流程进行了优化和重组，提出了基于GSP的医药商业企业ERP系统的设计方案，然后结合温州市医药商业企业的具体实际，给出了ERP系统实施的策略。最后本论文还对本系统进行了展望，即提出了今后改进的方向。